Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms