Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP2Q96F07 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYFIP2Q96F07 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYFIP2Q96F07 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CYFIP2Q96F07 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYFIP2Q96F07 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms