Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21AQ96BD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF21AQ96BD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms