Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN3Q969G5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN3Q969G5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAVIN3Q969G5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 492.6 ms