Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF1Q8NHV9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF1Q8NHV9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF1Q8NHV9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms