Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGI4Q8N135 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI4Q8N135 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGI4Q8N135 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGI4Q8N135 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms