Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC13Q8IYE1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC13Q8IYE1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC13Q8IYE1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC13Q8IYE1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC13Q8IYE1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC13Q8IYE1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC13Q8IYE1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC13Q8IYE1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC13Q8IYE1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC13Q8IYE1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC13Q8IYE1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms