Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACD2Q6Y1H2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD2Q6Y1H2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD2Q6Y1H2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD2Q6Y1H2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms