Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLPSL2Q6UWE3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPSL2Q6UWE3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms