Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 XPR1-205ENST00000498177 485 ntTSL 52.92□□□□□ -1.946e-19■■■■■ 67.3
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PRPF8Q6P2Q9 RFC4-202ENST00000392481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-8■■■■■ 67
PRPF8Q6P2Q9 RFC4-201ENST00000296273 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.951e-8■■■■■ 67
PRPF8Q6P2Q9 MPP6-206ENST00000432190 982 ntTSL 320.32■□□□□ 0.845e-18■■■■■ 67
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PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.355e-13■■■■■ 67
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PRPF8Q6P2Q9 MARCH7-208ENST00000478396 797 ntTSL 5-0.22□□□□□ -2.452e-7■■■■■ 67
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PRPF8Q6P2Q9 AASDHPPT-204ENST00000533423 568 ntTSL 31.72□□□□□ -2.137e-12■■■■■ 65.4
PRPF8Q6P2Q9 AASDHPPT-202ENST00000524411 629 ntTSL 30.9□□□□□ -2.267e-12■■■■■ 65.4
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PRPF8Q6P2Q9 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.39e-7■■■■■ 65.3
PRPF8Q6P2Q9 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.459e-7■■■■■ 65.3
PRPF8Q6P2Q9 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.99e-7■■■■■ 65.3
PRPF8Q6P2Q9 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.099e-7■■■■■ 65.3
PRPF8Q6P2Q9 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.042e-8■■■■■ 65.2
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PRPF8Q6P2Q9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-8■■■■■ 64.9
PRPF8Q6P2Q9 PMPCB-204ENST00000444457 2385 ntTSL 214.06□□□□□ -0.164e-8■■■■■ 64.9
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PRPF8Q6P2Q9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 64.9
PRPF8Q6P2Q9 G2E3-208ENST00000549553 587 ntTSL 26.15□□□□□ -1.437e-17■■■■■ 64.9
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PRPF8Q6P2Q9 RFC4-210ENST00000449502 799 ntTSL 37.49□□□□□ -1.215e-8■■■■■ 64.9
PRPF8Q6P2Q9 RFC4-205ENST00000418288 701 ntTSL 22.18□□□□□ -2.065e-8■■■■■ 64.9
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