Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UFSP1Q6NVU6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP1Q6NVU6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UFSP1Q6NVU6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP1Q6NVU6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP1Q6NVU6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP1Q6NVU6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP1Q6NVU6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP1Q6NVU6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms