Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGNBP1Q5YKI7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GGNBP1Q5YKI7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms