Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RNF123Q5XPI4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RNF123Q5XPI4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RNF123Q5XPI4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RNF123Q5XPI4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RNF123Q5XPI4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms