Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF3Q5VWG9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF3Q5VWG9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF3Q5VWG9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF3Q5VWG9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms