Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N8

FAM27D1, Protein FAM27D1, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27D1Q5T7N8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM27D1Q5T7N8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM27D1Q5T7N8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM27D1Q5T7N8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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