Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ODF2Q5BJF6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ODF2Q5BJF6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms