Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAL1Q4LDG9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAL1Q4LDG9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAL1Q4LDG9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAL1Q4LDG9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms