Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF260Q3ZCT1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF260Q3ZCT1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF260Q3ZCT1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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