Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA9Q13797 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA9Q13797 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA9Q13797 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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