Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD300CQ08708 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD300CQ08708 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CD300CQ08708 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms