Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLH2Q02577 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLH2Q02577 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NHLH2Q02577 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms