Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNA1BQ00975 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1BQ00975 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA1BQ00975 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1BQ00975 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1BQ00975 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms