Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPAP78324 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIRPAP78324 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRPAP78324 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms