Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL11P62913 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL11P62913 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL11P62913 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL11P62913 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL11P62913 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL11P62913 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL11P62913 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL11P62913 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL11P62913 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL11P62913 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL11P62913 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL11P62913 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL11P62913 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL11P62913 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL11P62913 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL11P62913 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL11P62913 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL11P62913 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL11P62913 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL11P62913 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL11P62913 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL11P62913 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL11P62913 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL11P62913 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL11P62913 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL11P62913 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL11P62913 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL11P62913 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL11P62913 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL11P62913 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL11P62913 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL11P62913 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL11P62913 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL11P62913 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL11P62913 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL11P62913 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL11P62913 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL11P62913 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL11P62913 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL11P62913 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL11P62913 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL11P62913 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL11P62913 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL11P62913 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL11P62913 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL11P62913 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL11P62913 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL11P62913 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL11P62913 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL11P62913 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL11P62913 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL11P62913 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL11P62913 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL11P62913 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL11P62913 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL11P62913 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL11P62913 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL11P62913 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL11P62913 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL11P62913 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL11P62913 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL11P62913 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL11P62913 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL11P62913 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL11P62913 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL11P62913 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL11P62913 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL11P62913 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL11P62913 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL11P62913 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL11P62913 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL11P62913 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL11P62913 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL11P62913 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL11P62913 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL11P62913 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL11P62913 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL11P62913 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL11P62913 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL11P62913 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL11P62913 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL11P62913 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL11P62913 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL11P62913 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL11P62913 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL11P62913 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL11P62913 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL11P62913 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL11P62913 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL11P62913 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL11P62913 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL11P62913 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL11P62913 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL11P62913 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL11P62913 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL11P62913 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL11P62913 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL11P62913 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL11P62913 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms