Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
UTRNP46939 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UTRNP46939 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UTRNP46939 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UTRNP46939 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
UTRNP46939 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
UTRNP46939 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UTRNP46939 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
UTRNP46939 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UTRNP46939 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UTRNP46939 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
UTRNP46939 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
UTRNP46939 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
UTRNP46939 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
UTRNP46939 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
UTRNP46939 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
UTRNP46939 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
UTRNP46939 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
UTRNP46939 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
UTRNP46939 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
UTRNP46939 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
UTRNP46939 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
UTRNP46939 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
UTRNP46939 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
UTRNP46939 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UTRNP46939 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UTRNP46939 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
UTRNP46939 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
UTRNP46939 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
UTRNP46939 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
UTRNP46939 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
UTRNP46939 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
UTRNP46939 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
UTRNP46939 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
UTRNP46939 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
UTRNP46939 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
UTRNP46939 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
UTRNP46939 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
UTRNP46939 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
UTRNP46939 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
UTRNP46939 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
UTRNP46939 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
UTRNP46939 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
UTRNP46939 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
UTRNP46939 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
UTRNP46939 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
UTRNP46939 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
UTRNP46939 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
UTRNP46939 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
UTRNP46939 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
UTRNP46939 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
UTRNP46939 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
UTRNP46939 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UTRNP46939 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
UTRNP46939 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UTRNP46939 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
UTRNP46939 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
UTRNP46939 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
UTRNP46939 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
UTRNP46939 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
UTRNP46939 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
UTRNP46939 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
UTRNP46939 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
UTRNP46939 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
UTRNP46939 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
UTRNP46939 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
UTRNP46939 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
UTRNP46939 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
UTRNP46939 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms