Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCAP37840 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCAP37840 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCAP37840 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCAP37840 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCAP37840 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCAP37840 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCAP37840 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCAP37840 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCAP37840 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCAP37840 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCAP37840 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCAP37840 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCAP37840 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCAP37840 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCAP37840 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCAP37840 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCAP37840 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCAP37840 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCAP37840 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCAP37840 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCAP37840 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCAP37840 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCAP37840 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCAP37840 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCAP37840 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCAP37840 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCAP37840 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCAP37840 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCAP37840 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCAP37840 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCAP37840 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCAP37840 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCAP37840 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCAP37840 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCAP37840 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCAP37840 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCAP37840 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCAP37840 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCAP37840 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCAP37840 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCAP37840 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCAP37840 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCAP37840 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCAP37840 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCAP37840 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNCAP37840 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNCAP37840 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCAP37840 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCAP37840 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCAP37840 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCAP37840 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCAP37840 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCAP37840 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCAP37840 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCAP37840 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCAP37840 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCAP37840 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCAP37840 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCAP37840 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCAP37840 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCAP37840 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCAP37840 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCAP37840 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCAP37840 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCAP37840 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCAP37840 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCAP37840 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCAP37840 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCAP37840 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCAP37840 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCAP37840 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCAP37840 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCAP37840 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCAP37840 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCAP37840 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCAP37840 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCAP37840 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCAP37840 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCAP37840 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCAP37840 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCAP37840 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNCAP37840 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNCAP37840 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCAP37840 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCAP37840 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCAP37840 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCAP37840 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCAP37840 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms