Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX6P35712 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX6P35712 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX6P35712 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX6P35712 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX6P35712 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX6P35712 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX6P35712 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX6P35712 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX6P35712 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX6P35712 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX6P35712 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX6P35712 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX6P35712 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX6P35712 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX6P35712 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX6P35712 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX6P35712 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX6P35712 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX6P35712 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX6P35712 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX6P35712 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX6P35712 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX6P35712 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX6P35712 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX6P35712 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX6P35712 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX6P35712 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX6P35712 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX6P35712 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX6P35712 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX6P35712 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX6P35712 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX6P35712 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX6P35712 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX6P35712 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX6P35712 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX6P35712 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX6P35712 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX6P35712 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX6P35712 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX6P35712 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX6P35712 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX6P35712 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX6P35712 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX6P35712 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX6P35712 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX6P35712 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX6P35712 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX6P35712 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX6P35712 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX6P35712 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX6P35712 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX6P35712 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX6P35712 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX6P35712 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX6P35712 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX6P35712 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX6P35712 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX6P35712 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX6P35712 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX6P35712 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX6P35712 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX6P35712 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX6P35712 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX6P35712 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX6P35712 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX6P35712 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX6P35712 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX6P35712 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX6P35712 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX6P35712 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX6P35712 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX6P35712 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX6P35712 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX6P35712 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX6P35712 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX6P35712 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX6P35712 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX6P35712 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX6P35712 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX6P35712 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX6P35712 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX6P35712 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX6P35712 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX6P35712 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX6P35712 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX6P35712 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX6P35712 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX6P35712 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX6P35712 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX6P35712 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX6P35712 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX6P35712 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX6P35712 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX6P35712 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX6P35712 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX6P35712 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX6P35712 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX6P35712 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms