Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
GTF2E1P29083 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
GTF2E1P29083 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
GTF2E1P29083 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GTF2E1P29083 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms