Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CRYBB3P26998 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CRYBB3P26998 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CRYBB3P26998 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CRYBB3P26998 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CRYBB3P26998 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CRYBB3P26998 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRYBB3P26998 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRYBB3P26998 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms