Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CA4P22748 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CA4P22748 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CA4P22748 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CA4P22748 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CA4P22748 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CA4P22748 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CA4P22748 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CA4P22748 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CA4P22748 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CA4P22748 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CA4P22748 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CA4P22748 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CA4P22748 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CA4P22748 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CA4P22748 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CA4P22748 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CA4P22748 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CA4P22748 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CA4P22748 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CA4P22748 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CA4P22748 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CA4P22748 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CA4P22748 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CA4P22748 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CA4P22748 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CA4P22748 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CA4P22748 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CA4P22748 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CA4P22748 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CA4P22748 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CA4P22748 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA4P22748 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA4P22748 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA4P22748 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA4P22748 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA4P22748 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA4P22748 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA4P22748 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA4P22748 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA4P22748 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA4P22748 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA4P22748 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA4P22748 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA4P22748 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA4P22748 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA4P22748 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA4P22748 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA4P22748 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA4P22748 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA4P22748 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA4P22748 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA4P22748 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA4P22748 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA4P22748 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA4P22748 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA4P22748 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA4P22748 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA4P22748 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA4P22748 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA4P22748 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA4P22748 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CA4P22748 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CA4P22748 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CA4P22748 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA4P22748 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA4P22748 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA4P22748 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA4P22748 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CA4P22748 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CA4P22748 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CA4P22748 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CA4P22748 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CA4P22748 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CA4P22748 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CA4P22748 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CA4P22748 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CA4P22748 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CA4P22748 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CA4P22748 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CA4P22748 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CA4P22748 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA4P22748 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA4P22748 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms