Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMB1P20618 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB1P20618 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms