Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB1P18505 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRB1P18505 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB1P18505 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB1P18505 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms