Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEPDP12955 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEPDP12955 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PEPDP12955 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEPDP12955 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEPDP12955 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEPDP12955 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEPDP12955 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEPDP12955 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEPDP12955 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEPDP12955 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEPDP12955 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEPDP12955 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEPDP12955 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEPDP12955 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEPDP12955 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEPDP12955 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEPDP12955 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEPDP12955 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEPDP12955 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEPDP12955 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEPDP12955 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEPDP12955 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PEPDP12955 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEPDP12955 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEPDP12955 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEPDP12955 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEPDP12955 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PEPDP12955 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEPDP12955 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEPDP12955 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEPDP12955 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEPDP12955 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEPDP12955 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEPDP12955 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEPDP12955 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEPDP12955 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEPDP12955 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEPDP12955 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEPDP12955 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEPDP12955 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEPDP12955 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEPDP12955 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEPDP12955 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEPDP12955 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEPDP12955 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEPDP12955 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEPDP12955 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEPDP12955 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEPDP12955 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEPDP12955 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEPDP12955 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEPDP12955 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEPDP12955 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEPDP12955 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEPDP12955 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEPDP12955 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEPDP12955 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEPDP12955 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEPDP12955 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEPDP12955 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEPDP12955 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEPDP12955 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEPDP12955 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEPDP12955 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEPDP12955 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEPDP12955 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEPDP12955 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEPDP12955 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PEPDP12955 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEPDP12955 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEPDP12955 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PEPDP12955 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEPDP12955 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEPDP12955 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PEPDP12955 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEPDP12955 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEPDP12955 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEPDP12955 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEPDP12955 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEPDP12955 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PEPDP12955 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEPDP12955 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEPDP12955 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEPDP12955 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEPDP12955 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEPDP12955 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEPDP12955 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEPDP12955 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEPDP12955 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEPDP12955 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEPDP12955 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEPDP12955 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEPDP12955 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEPDP12955 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEPDP12955 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEPDP12955 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEPDP12955 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEPDP12955 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEPDP12955 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms