Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN1P07384 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN1P07384 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN1P07384 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN1P07384 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN1P07384 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN1P07384 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN1P07384 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN1P07384 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN1P07384 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN1P07384 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN1P07384 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms