Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDRT1O95170 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDRT1O95170 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDRT1O95170 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms