Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA2O75334 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIA2O75334 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA2O75334 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms