Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DIRC3C9JPN6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DIRC3C9JPN6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DIRC3C9JPN6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DIRC3C9JPN6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DIRC3C9JPN6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DIRC3C9JPN6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DIRC3C9JPN6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DIRC3C9JPN6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DIRC3C9JPN6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DIRC3C9JPN6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DIRC3C9JPN6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DIRC3C9JPN6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DIRC3C9JPN6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DIRC3C9JPN6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms