RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A FAP1P53971 965 aa4.97□□□□□ -1.61
YPL060C-AYPL060C-A PRY3P47033 881 aa4.62□□□□□ -1.67
YPL060C-AYPL060C-A HAA1Q12753 694 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
YPL060C-AYPL060C-A MTC1P47018 478 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
YPL060C-AYPL060C-A AAD16Q02895 342 aa3.92□□□□□ -1.78
YPL060C-AYPL060C-A DRS1P32892 752 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YPL060C-AYPL060C-A ISW2Q08773 1120 aa3.67□□□□□ -1.82
YPL060C-AYPL060C-A SIS1P25294 352 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
YPL060C-AYPL060C-A TSR3Q12094 313 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
YPL060C-AYPL060C-A YCK3P39962 524 aa3.62□□□□□ -1.83
YPL060C-AYPL060C-A PRI1P10363 409 aa3.59□□□□□ -1.84
YPL060C-AYPL060C-A MRPL32P25348 183 aa3.57□□□□□ -1.84
YPL060C-AYPL060C-A YGL015CP33199 130 aa3.54□□□□□ -1.84
YPL060C-AYPL060C-A RPG1P38249 964 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YPL060C-AYPL060C-A REB1P21538 810 aa3.53□□□□□ -1.84
YPL060C-AYPL060C-A BUD31P25337 157 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
YPL060C-AYPL060C-A RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YPL060C-AYPL060C-A RPL17AP05740 184 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YPL060C-AYPL060C-A RPL17BP46990 184 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YPL060C-AYPL060C-A UBP9P39967 754 aa3.33□□□□□ -1.88
YPL060C-AYPL060C-A DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
YPL060C-AYPL060C-A BFR2Q06631 534 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YPL060C-AYPL060C-A TIF4632P39936 914 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YPL060C-AYPL060C-A YJL171CP46992 396 aa3.1□□□□□ -1.91
YPL060C-AYPL060C-A GTT3P39996 337 aa3.08□□□□□ -1.92
YPL060C-AYPL060C-A YIL055CP40523 627 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YPL060C-AYPL060C-A PTP3P40048 928 aa3.06□□□□□ -1.92
YPL060C-AYPL060C-A MAP2P38174 421 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YPL060C-AYPL060C-A SCY1P53009 804 aa3.03□□□□□ -1.92
YPL060C-AYPL060C-A SLX5P32828 619 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YPL060C-AYPL060C-A HOP09932 586 aa3.01□□□□□ -1.93
YPL060C-AYPL060C-A YAH1Q12184 172 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YPL060C-AYPL060C-A WSC3Q12215 556 aa2.97□□□□□ -1.93
YPL060C-AYPL060C-A UBP10P53874 792 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
YPL060C-AYPL060C-A DCD1P06773 312 aa2.94□□□□□ -1.94
YPL060C-AYPL060C-A TFG1P41895 735 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
YPL060C-AYPL060C-A BBC1P47068 1157 aa2.92□□□□□ -1.94
YPL060C-AYPL060C-A CDC27P38042 758 aa2.91□□□□□ -1.94
YPL060C-AYPL060C-A YBL029C-AQ3E756 94 aa2.86□□□□□ -1.95
YPL060C-AYPL060C-A SPP1Q03012 353 aa2.85□□□□□ -1.95
YPL060C-AYPL060C-A PIB1Q06651 286 aa2.83□□□□□ -1.96
YPL060C-AYPL060C-A ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data2.82□□□□□ -1.96not detected
YPL060C-AYPL060C-A YOR238WQ08634 303 aa2.81□□□□□ -1.96
YPL060C-AYPL060C-A TGL3P40308 642 aa2.8□□□□□ -1.96
YPL060C-AYPL060C-A GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data2.79□□□□□ -1.96not detected
YPL060C-AYPL060C-A PEX29Q03370 554 aa2.76□□□□□ -1.97
YPL060C-AYPL060C-A TFC8Q12308 588 aa2.76□□□□□ -1.97
YPL060C-AYPL060C-A BMT6Q12291 365 aa2.75□□□□□ -1.97
YPL060C-AYPL060C-A AVT3P36062 692 aa2.74□□□□□ -1.97
YPL060C-AYPL060C-A TFA1P36100 482 aa2.72□□□□□ -1.97
YPL060C-AYPL060C-A YAP5P40574 245 aa2.72□□□□□ -1.97
YPL060C-AYPL060C-A YKR023WP36119 530 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YPL060C-AYPL060C-A ULI1P43604 169 aa2.7□□□□□ -1.98
YPL060C-AYPL060C-A EPS1P40557 701 aa2.7□□□□□ -1.98
YPL060C-AYPL060C-A RSM7P47150 247 aa2.69□□□□□ -1.98
YPL060C-AYPL060C-A BCH2P36122 765 aa2.68□□□□□ -1.98
YPL060C-AYPL060C-A SET4P42948 560 aa2.68□□□□□ -1.98
YPL060C-AYPL060C-A ELP4Q02884 456 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
YPL060C-AYPL060C-A AI2P03876 854 aa2.65□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A VNX1P42839 908 aa2.65□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A MRM1P25270 412 aa2.64□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A YFR006WP43590 535 aa2.63□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A TIF11P38912 153 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A SPT21P35209 758 aa2.62□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A MIF2P35201 549 aa2.61□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A EAP1P36041 632 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A DCW1P36091 449 aa2.61□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A SAP30P38429 201 aa2.61□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A BDF1P35817 686 aa2.61□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A AIR2Q12476 344 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A LDB19Q12502 818 aa2.6□□□□□ -1.99
YPL060C-AYPL060C-A NCR1Q12200 1170 aa2.59□□□□□ -2
YPL060C-AYPL060C-A FKH1P40466 484 aa2.58□□□□□ -2
YPL060C-AYPL060C-A RTG1P32607 177 aa2.58□□□□□ -2
YPL060C-AYPL060C-A ATH1P48016 1211 aa2.56□□□□□ -2
YPL060C-AYPL060C-A GYP5Q12344 894 aa2.56□□□□□ -2
YPL060C-AYPL060C-A RIM101P33400 625 aa2.54□□□□□ -2
YPL060C-AYPL060C-A RPP1BP10622 106 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
YPL060C-AYPL060C-A DBP1P24784 617 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
YPL060C-AYPL060C-A SSP1P38871 571 aa2.53□□□□□ -2
YPL060C-AYPL060C-A BCK2P33306 851 aa2.52□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A HTA1P04911 132 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A HTA2P04912 132 aa2.52□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A IFH1P39520 1085 aa2.51□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A PEX21P50091 288 aa2.51□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A YNL035CP53962 389 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A RTG3P38165 486 aa2.5□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A KIC1P38692 1080 aa2.5□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A YOL036WQ08206 761 aa2.5□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A MSB4Q12317 492 aa2.49□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A GRE2Q12068 342 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data2.47□□□□□ -2.01not detected
YPL060C-AYPL060C-A TRP5P00931 707 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A GYP1Q08484 637 aa2.47□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A YDL129WQ07555 291 aa2.47□□□□□ -2.01
YPL060C-AYPL060C-A OXP1P28273 1286 aa2.46□□□□□ -2.02
YPL060C-AYPL060C-A NPL4P33755 580 aa2.45□□□□□ -2.02
YPL060C-AYPL060C-A DPS1P04802 557 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
YPL060C-AYPL060C-A GAR1P28007 205 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
YPL060C-AYPL060C-A VRP1P37370 817 aa2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms