RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeastyeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9YOL089C MTC1P47018 478 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HAL9YOL089C FAP1P53971 965 aa7.3□□□□□ -1.24
HAL9YOL089C DRS1P32892 752 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HAL9YOL089C PRY3P47033 881 aa6.82□□□□□ -1.32
HAL9YOL089C AAD16Q02895 342 aa6.54□□□□□ -1.36
HAL9YOL089C PRI1P10363 409 aa6.44□□□□□ -1.38
HAL9YOL089C ISW2Q08773 1120 aa6.39□□□□□ -1.39
HAL9YOL089C RPG1P38249 964 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HAL9YOL089C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HAL9YOL089C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HAL9YOL089C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HAL9YOL089C YCK3P39962 524 aa6.09□□□□□ -1.43
HAL9YOL089C MRPL32P25348 183 aa6.01□□□□□ -1.45
HAL9YOL089C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HAL9YOL089C REB1P21538 810 aa5.91□□□□□ -1.46
HAL9YOL089C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
HAL9YOL089C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
HAL9YOL089C YGL015CP33199 130 aa5.75□□□□□ -1.49
HAL9YOL089C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
HAL9YOL089C AVT3P36062 692 aa5.68□□□□□ -1.5
HAL9YOL089C CDC27P38042 758 aa5.53□□□□□ -1.52
HAL9YOL089C HOP09932 586 aa5.45□□□□□ -1.54
HAL9YOL089C MAP2P38174 421 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
HAL9YOL089C DCD1P06773 312 aa5.43□□□□□ -1.54
HAL9YOL089C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
HAL9YOL089C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
HAL9YOL089C SPT21P35209 758 aa5.37□□□□□ -1.55
HAL9YOL089C SCY1P53009 804 aa5.34□□□□□ -1.55
HAL9YOL089C TFC8Q12308 588 aa5.33□□□□□ -1.56
HAL9YOL089C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
HAL9YOL089C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
HAL9YOL089C SLX5P32828 619 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
HAL9YOL089C SIS1P25294 352 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
HAL9YOL089C UBP9P39967 754 aa5.19□□□□□ -1.58
HAL9YOL089C BCH2P36122 765 aa5.17□□□□□ -1.58
HAL9YOL089C RIM101P33400 625 aa5.15□□□□□ -1.58
HAL9YOL089C PTP3P40048 928 aa5.15□□□□□ -1.58
HAL9YOL089C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
HAL9YOL089C TGL3P40308 642 aa5.13□□□□□ -1.59
HAL9YOL089C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HAL9YOL089C EPS1P40557 701 aa5.04□□□□□ -1.6
HAL9YOL089C BDF1P35817 686 aa5.01□□□□□ -1.61
HAL9YOL089C BBC1P47068 1157 aa5.01□□□□□ -1.61
HAL9YOL089C OXP1P28273 1286 aa5□□□□□ -1.61
HAL9YOL089C YOR238WQ08634 303 aa4.96□□□□□ -1.62
HAL9YOL089C RSM7P47150 247 aa4.95□□□□□ -1.62
HAL9YOL089C WSC3Q12215 556 aa4.94□□□□□ -1.62
HAL9YOL089C YBL029C-AQ3E756 94 aa4.94□□□□□ -1.62
HAL9YOL089C AI2P03876 854 aa4.92□□□□□ -1.62
HAL9YOL089C GTT3P39996 337 aa4.92□□□□□ -1.62
HAL9YOL089C SPP1Q03012 353 aa4.88□□□□□ -1.63
HAL9YOL089C YAP5P40574 245 aa4.87□□□□□ -1.63
HAL9YOL089C PIB1Q06651 286 aa4.85□□□□□ -1.63
HAL9YOL089C TFA1P36100 482 aa4.83□□□□□ -1.64
HAL9YOL089C YJL171CP46992 396 aa4.83□□□□□ -1.64
HAL9YOL089C VNX1P42839 908 aa4.81□□□□□ -1.64
HAL9YOL089C MST1P07236 462 aa4.78□□□□□ -1.64
HAL9YOL089C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data4.78□□□□□ -1.64not detected
HAL9YOL089C MRM1P25270 412 aa4.77□□□□□ -1.65
HAL9YOL089C YLR271WQ06152 274 aa4.76□□□□□ -1.65
HAL9YOL089C TIF11P38912 153 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HAL9YOL089C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.72□□□□□ -1.65not detected
HAL9YOL089C ULI1P43604 169 aa4.72□□□□□ -1.65
HAL9YOL089C SSP1P38871 571 aa4.71□□□□□ -1.66
HAL9YOL089C LDB19Q12502 818 aa4.69□□□□□ -1.66
HAL9YOL089C SET4P42948 560 aa4.68□□□□□ -1.66
HAL9YOL089C YFR006WP43590 535 aa4.67□□□□□ -1.66
HAL9YOL089C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
HAL9YOL089C BMT6Q12291 365 aa4.65□□□□□ -1.67
HAL9YOL089C DBP1P24784 617 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
HAL9YOL089C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
HAL9YOL089C FKH1P40466 484 aa4.63□□□□□ -1.67
HAL9YOL089C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
HAL9YOL089C EAP1P36041 632 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
HAL9YOL089C RTG3P38165 486 aa4.61□□□□□ -1.67
HAL9YOL089C CST9Q06032 482 aa4.61□□□□□ -1.67
HAL9YOL089C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data4.6□□□□□ -1.67not detected
HAL9YOL089C YOL036WQ08206 761 aa4.6□□□□□ -1.67
HAL9YOL089C RTG1P32607 177 aa4.59□□□□□ -1.67
HAL9YOL089C MGA2P40578 1113 aa4.59□□□□□ -1.67
HAL9YOL089C MSB4Q12317 492 aa4.59□□□□□ -1.68
HAL9YOL089C NCR1Q12200 1170 aa4.58□□□□□ -1.68
HAL9YOL089C TRP5P00931 707 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
HAL9YOL089C IOC2Q12072 812 aa4.56□□□□□ -1.68
HAL9YOL089C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
HAL9YOL089C VPS29P38759 282 aa4.53□□□□□ -1.68
HAL9YOL089C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
HAL9YOL089C DCW1P36091 449 aa4.52□□□□□ -1.69
HAL9YOL089C STS1P38637 319 aa4.52□□□□□ -1.69
HAL9YOL089C GYP5Q12344 894 aa4.52□□□□□ -1.69
HAL9YOL089C SAP30P38429 201 aa4.52□□□□□ -1.69
HAL9YOL089C RCR1P38212 213 aa4.51□□□□□ -1.69
HAL9YOL089C SEC61P32915 480 aa4.48□□□□□ -1.69
HAL9YOL089C MIF2P35201 549 aa4.48□□□□□ -1.69
HAL9YOL089C HTA1P04911 132 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
HAL9YOL089C HTA2P04912 132 aa4.47□□□□□ -1.69
HAL9YOL089C JIP4Q03361 876 aa4.44□□□□□ -1.7
HAL9YOL089C YDL129WQ07555 291 aa4.44□□□□□ -1.7
HAL9YOL089C SAM3Q08986 587 aa4.44□□□□□ -1.7
HAL9YOL089C ABP1P15891 592 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
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