RNA–Protein interactions for RNA: YMR315W

YMR315W, Transcript of Protein with NADP(H) oxidoreductase activity, yeastyeast

Gene YMR315W, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR315WYMR315W FAP1P53971 965 aa12□□□□□ -0.49
YMR315WYMR315W MTC1P47018 478 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
YMR315WYMR315W PRY3P47033 881 aa11.32□□□□□ -0.6
YMR315WYMR315W DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
YMR315WYMR315W AAD16Q02895 342 aa10.74□□□□□ -0.69
YMR315WYMR315W PRI1P10363 409 aa10.66□□□□□ -0.7
YMR315WYMR315W YCK3P39962 524 aa10.62□□□□□ -0.71
YMR315WYMR315W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
YMR315WYMR315W ISW2Q08773 1120 aa10.12□□□□□ -0.79
YMR315WYMR315W RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
YMR315WYMR315W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
YMR315WYMR315W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
YMR315WYMR315W MRPL32P25348 183 aa9.64□□□□□ -0.87
YMR315WYMR315W AVT3P36062 692 aa9.55□□□□□ -0.88
YMR315WYMR315W YGL015CP33199 130 aa9.53□□□□□ -0.88
YMR315WYMR315W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
YMR315WYMR315W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
YMR315WYMR315W TFA1P36100 482 aa9.2□□□□□ -0.94
YMR315WYMR315W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
YMR315WYMR315W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
YMR315WYMR315W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
YMR315WYMR315W REB1P21538 810 aa9.13□□□□□ -0.95
YMR315WYMR315W CDC27P38042 758 aa8.97□□□□□ -0.97
YMR315WYMR315W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
YMR315WYMR315W SPT21P35209 758 aa8.83□□□□□ -1
YMR315WYMR315W MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YMR315WYMR315W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
YMR315WYMR315W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
YMR315WYMR315W SIS1P25294 352 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
YMR315WYMR315W DCD1P06773 312 aa8.55□□□□□ -1.04
YMR315WYMR315W HOP09932 586 aa8.55□□□□□ -1.04
YMR315WYMR315W RIM101P33400 625 aa8.53□□□□□ -1.04
YMR315WYMR315W UBP9P39967 754 aa8.52□□□□□ -1.05
YMR315WYMR315W TFC8Q12308 588 aa8.51□□□□□ -1.05
YMR315WYMR315W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YMR315WYMR315W SCY1P53009 804 aa8.46□□□□□ -1.06
YMR315WYMR315W TGL3P40308 642 aa8.45□□□□□ -1.06
YMR315WYMR315W SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YMR315WYMR315W TAF7Q05021 590 aa8.33□□□□□ -1.08
YMR315WYMR315W OXP1P28273 1286 aa8.27□□□□□ -1.09
YMR315WYMR315W BCH2P36122 765 aa8.22□□□□□ -1.09
YMR315WYMR315W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YMR315WYMR315W PTP3P40048 928 aa8.05□□□□□ -1.12
YMR315WYMR315W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.05□□□□□ -1.12
YMR315WYMR315W EPS1P40557 701 aa8.02□□□□□ -1.13
YMR315WYMR315W BDF1P35817 686 aa7.99□□□□□ -1.13
YMR315WYMR315W RSM7P47150 247 aa7.97□□□□□ -1.13
YMR315WYMR315W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YMR315WYMR315W MST1P07236 462 aa7.95□□□□□ -1.14
YMR315WYMR315W DMA1P38823 416 aa7.95□□□□□ -1.14
YMR315WYMR315W BBC1P47068 1157 aa7.9□□□□□ -1.14
YMR315WYMR315W YOR238WQ08634 303 aa7.9□□□□□ -1.14
YMR315WYMR315W AI2P03876 854 aa7.89□□□□□ -1.15
YMR315WYMR315W VNX1P42839 908 aa7.89□□□□□ -1.15
YMR315WYMR315W YLR271WQ06152 274 aa7.89□□□□□ -1.15
YMR315WYMR315W SPP1Q03012 353 aa7.83□□□□□ -1.16
YMR315WYMR315W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.79□□□□□ -1.16not detected
YMR315WYMR315W SSP1P38871 571 aa7.78□□□□□ -1.16
YMR315WYMR315W WSC3Q12215 556 aa7.78□□□□□ -1.16
YMR315WYMR315W LEO1P38439 464 aa7.77□□□□□ -1.17
YMR315WYMR315W YJL171CP46992 396 aa7.77□□□□□ -1.17
YMR315WYMR315W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
YMR315WYMR315W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
YMR315WYMR315W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.71□□□□□ -1.18not detected
YMR315WYMR315W YAP5P40574 245 aa7.69□□□□□ -1.18
YMR315WYMR315W FKH1P40466 484 aa7.68□□□□□ -1.18
YMR315WYMR315W TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
YMR315WYMR315W CST9Q06032 482 aa7.62□□□□□ -1.19
YMR315WYMR315W MRM1P25270 412 aa7.61□□□□□ -1.19
YMR315WYMR315W MGA2P40578 1113 aa7.58□□□□□ -1.2
YMR315WYMR315W GTT3P39996 337 aa7.57□□□□□ -1.2
YMR315WYMR315W LDB19Q12502 818 aa7.57□□□□□ -1.2
YMR315WYMR315W BMT6Q12291 365 aa7.56□□□□□ -1.2
YMR315WYMR315W ULI1P43604 169 aa7.52□□□□□ -1.21
YMR315WYMR315W IOC2Q12072 812 aa7.49□□□□□ -1.21
YMR315WYMR315W VPS29P38759 282 aa7.48□□□□□ -1.21
YMR315WYMR315W RTG3P38165 486 aa7.47□□□□□ -1.21
YMR315WYMR315W PIB1Q06651 286 aa7.46□□□□□ -1.22
YMR315WYMR315W RCR1P38212 213 aa7.44□□□□□ -1.22
YMR315WYMR315W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.44□□□□□ -1.22not detected
YMR315WYMR315W DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
YMR315WYMR315W STS1P38637 319 aa7.39□□□□□ -1.23
YMR315WYMR315W YFR006WP43590 535 aa7.37□□□□□ -1.23
YMR315WYMR315W MSB4Q12317 492 aa7.37□□□□□ -1.23
YMR315WYMR315W LEU3P08638 886 aa7.33□□□□□ -1.24
YMR315WYMR315W RTG1P32607 177 aa7.33□□□□□ -1.24
YMR315WYMR315W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
YMR315WYMR315W EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
YMR315WYMR315W YOL036WQ08206 761 aa7.31□□□□□ -1.24
YMR315WYMR315W SAM3Q08986 587 aa7.31□□□□□ -1.24
YMR315WYMR315W NCR1Q12200 1170 aa7.31□□□□□ -1.24
YMR315WYMR315W SET4P42948 560 aa7.28□□□□□ -1.24
YMR315WYMR315W TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YMR315WYMR315W RAM2P29703 316 aa7.25□□□□□ -1.25
YMR315WYMR315W ABP1P15891 592 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YMR315WYMR315W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YMR315WYMR315W SEC61P32915 480 aa7.2□□□□□ -1.26
YMR315WYMR315W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
YMR315WYMR315W GYP5Q12344 894 aa7.18□□□□□ -1.26
YMR315WYMR315W MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.2 ms