RNA–Protein interactions for RNA: YML003W

YML003W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YML003W, Length 873 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML003WYML003W MTC1P47018 478 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
YML003WYML003W FAP1P53971 965 aa14.05□□□□□ -0.16
YML003WYML003W DRS1P32892 752 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
YML003WYML003W PRY3P47033 881 aa13.22□□□□□ -0.29
YML003WYML003W PRI1P10363 409 aa12.91□□□□□ -0.34
YML003WYML003W AAD16Q02895 342 aa12.89□□□□□ -0.35
YML003WYML003W ISW2Q08773 1120 aa12.52□□□□□ -0.41
YML003WYML003W YCK3P39962 524 aa12.48□□□□□ -0.41
YML003WYML003W RPG1P38249 964 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
YML003WYML003W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
YML003WYML003W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
YML003WYML003W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
YML003WYML003W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
YML003WYML003W MRPL32P25348 183 aa11.7□□□□□ -0.54
YML003WYML003W AVT3P36062 692 aa11.4□□□□□ -0.58
YML003WYML003W REB1P21538 810 aa11.39□□□□□ -0.59
YML003WYML003W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
YML003WYML003W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
YML003WYML003W YGL015CP33199 130 aa11.37□□□□□ -0.59
YML003WYML003W CDC27P38042 758 aa11.01□□□□□ -0.65
YML003WYML003W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
YML003WYML003W SPT21P35209 758 aa10.86□□□□□ -0.67
YML003WYML003W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
YML003WYML003W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
YML003WYML003W MAP2P38174 421 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
YML003WYML003W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
YML003WYML003W TFC8Q12308 588 aa10.64□□□□□ -0.71
YML003WYML003W HOP09932 586 aa10.62□□□□□ -0.71
YML003WYML003W DCD1P06773 312 aa10.59□□□□□ -0.71
YML003WYML003W SCY1P53009 804 aa10.42□□□□□ -0.74
YML003WYML003W RIM101P33400 625 aa10.37□□□□□ -0.75
YML003WYML003W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
YML003WYML003W SLX5P32828 619 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
YML003WYML003W TGL3P40308 642 aa10.32□□□□□ -0.76
YML003WYML003W BCH2P36122 765 aa10.27□□□□□ -0.77
YML003WYML003W UBP9P39967 754 aa10.15□□□□□ -0.78
YML003WYML003W SIS1P25294 352 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
YML003WYML003W OXP1P28273 1286 aa10□□□□□ -0.81
YML003WYML003W EPS1P40557 701 aa9.98□□□□□ -0.81
YML003WYML003W BDF1P35817 686 aa9.95□□□□□ -0.82
YML003WYML003W PTP3P40048 928 aa9.86□□□□□ -0.83
YML003WYML003W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
YML003WYML003W MST1P07236 462 aa9.83□□□□□ -0.84
YML003WYML003W YOR238WQ08634 303 aa9.75□□□□□ -0.85
YML003WYML003W YBL029C-AQ3E756 94 aa9.73□□□□□ -0.85
YML003WYML003W BBC1P47068 1157 aa9.72□□□□□ -0.85
YML003WYML003W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data9.71□□□□□ -0.86not detected
YML003WYML003W RSM7P47150 247 aa9.71□□□□□ -0.86
YML003WYML003W AI2P03876 854 aa9.66□□□□□ -0.86
YML003WYML003W YAP5P40574 245 aa9.62□□□□□ -0.87
YML003WYML003W VNX1P42839 908 aa9.62□□□□□ -0.87
YML003WYML003W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
YML003WYML003W SPP1Q03012 353 aa9.52□□□□□ -0.89
YML003WYML003W WSC3Q12215 556 aa9.5□□□□□ -0.89
YML003WYML003W YLR271WQ06152 274 aa9.45□□□□□ -0.9
YML003WYML003W TFA1P36100 482 aa9.43□□□□□ -0.9
YML003WYML003W TIF11P38912 153 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
YML003WYML003W GTT3P39996 337 aa9.41□□□□□ -0.9
YML003WYML003W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
YML003WYML003W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
YML003WYML003W FKH1P40466 484 aa9.35□□□□□ -0.91
YML003WYML003W YJL171CP46992 396 aa9.31□□□□□ -0.92
YML003WYML003W PIB1Q06651 286 aa9.3□□□□□ -0.92
YML003WYML003W MRM1P25270 412 aa9.29□□□□□ -0.92
YML003WYML003W ULI1P43604 169 aa9.26□□□□□ -0.93
YML003WYML003W LDB19Q12502 818 aa9.26□□□□□ -0.93
YML003WYML003W IOC2Q12072 812 aa9.24□□□□□ -0.93
YML003WYML003W SSP1P38871 571 aa9.2□□□□□ -0.94
YML003WYML003W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data9.2□□□□□ -0.94not detected
YML003WYML003W MSB4Q12317 492 aa9.19□□□□□ -0.94
YML003WYML003W EAP1P36041 632 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
YML003WYML003W BMT6Q12291 365 aa9.15□□□□□ -0.94
YML003WYML003W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.11□□□□□ -0.95not detected
YML003WYML003W YOL036WQ08206 761 aa9.11□□□□□ -0.95
YML003WYML003W VPS29P38759 282 aa9.1□□□□□ -0.95
YML003WYML003W SET4P42948 560 aa9.09□□□□□ -0.95
YML003WYML003W DBP1P24784 617 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
YML003WYML003W CST9Q06032 482 aa9.08□□□□□ -0.96
YML003WYML003W TRP5P00931 707 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
YML003WYML003W RTG1P32607 177 aa9.06□□□□□ -0.96
YML003WYML003W RTG3P38165 486 aa9.06□□□□□ -0.96
YML003WYML003W YFR006WP43590 535 aa9.04□□□□□ -0.96
YML003WYML003W MGA2P40578 1113 aa9.03□□□□□ -0.96
YML003WYML003W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
YML003WYML003W STS1P38637 319 aa9.01□□□□□ -0.97
YML003WYML003W NCR1Q12200 1170 aa9.01□□□□□ -0.97
YML003WYML003W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
YML003WYML003W SAM3Q08986 587 aa8.99□□□□□ -0.97
YML003WYML003W SEC61P32915 480 aa8.98□□□□□ -0.97
YML003WYML003W RCR1P38212 213 aa8.92□□□□□ -0.98
YML003WYML003W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
YML003WYML003W ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
YML003WYML003W DAN4P47179 1161 aa8.85□□□□□ -0.99
YML003WYML003W JIP4Q03361 876 aa8.84□□□□□ -0.99
YML003WYML003W GYP5Q12344 894 aa8.83□□□□□ -1
YML003WYML003W SAP30P38429 201 aa8.8□□□□□ -1
YML003WYML003W HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
YML003WYML003W HTA2P04912 132 aa8.79□□□□□ -1
YML003WYML003W YDL129WQ07555 291 aa8.77□□□□□ -1.01
YML003WYML003W DCW1P36091 449 aa8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.2 ms