RNA–Protein interactions for RNA: YLR318W

EST2, Transcript of Reverse transcriptase subunit of the telomerase holoenzyme, yeast

Gene EST2, Length 2,655 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EST2	YLR318W	FAP1	P53971	965 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EST2	YLR318W	PRY3	P47033	881 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EST2	YLR318W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
EST2	YLR318W	YCK3	P39962	524 aa		4.43	□□□□□ -1.7
EST2	YLR318W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EST2	YLR318W	AAD16	Q02895	342 aa		4.34	□□□□□ -1.72
EST2	YLR318W	PRI1	P10363	409 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EST2	YLR318W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
EST2	YLR318W	YGL015C	P33199	130 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EST2	YLR318W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
EST2	YLR318W	ISW2	Q08773	1120 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EST2	YLR318W	MRPL32	P25348	183 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EST2	YLR318W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EST2	YLR318W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
EST2	YLR318W	UBP9	P39967	754 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EST2	YLR318W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
EST2	YLR318W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
EST2	YLR318W	CDC27	P38042	758 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EST2	YLR318W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
EST2	YLR318W	TGL3	P40308	642 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EST2	YLR318W	REB1	P21538	810 aa		3.28	□□□□□ -1.88
EST2	YLR318W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
EST2	YLR318W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
EST2	YLR318W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
EST2	YLR318W	YJL171C	P46992	396 aa		3.19	□□□□□ -1.9
EST2	YLR318W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
EST2	YLR318W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
EST2	YLR318W	SCY1	P53009	804 aa		3.18	□□□□□ -1.9
EST2	YLR318W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		3.17	□□□□□ -1.9
EST2	YLR318W	RGA2	Q06407	1009 aa		3.16	□□□□□ -1.9
EST2	YLR318W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
EST2	YLR318W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
EST2	YLR318W	VNX1	P42839	908 aa		3.11	□□□□□ -1.91
EST2	YLR318W	TFC8	Q12308	588 aa		3.1	□□□□□ -1.91
EST2	YLR318W	MST1	P07236	462 aa		3.09	□□□□□ -1.91
EST2	YLR318W	SPP1	Q03012	353 aa		3.09	□□□□□ -1.91
EST2	YLR318W	DCD1	P06773	312 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EST2	YLR318W	HO	P09932	586 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EST2	YLR318W	FKH1	P40466	484 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EST2	YLR318W	BMT6	Q12291	365 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EST2	YLR318W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
EST2	YLR318W	YOR238W	Q08634	303 aa		3.03	□□□□□ -1.92
EST2	YLR318W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
EST2	YLR318W	WSC3	Q12215	556 aa		2.97	□□□□□ -1.93
EST2	YLR318W	SPT21	P35209	758 aa		2.96	□□□□□ -1.93
EST2	YLR318W	BCH2	P36122	765 aa		2.96	□□□□□ -1.94
EST2	YLR318W	LDB19	Q12502	818 aa		2.94	□□□□□ -1.94
EST2	YLR318W	RGA1	P39083	1007 aa		2.94	□□□□□ -1.94
EST2	YLR318W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.92	□□□□□ -1.94	not detected
EST2	YLR318W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
EST2	YLR318W	TFA1	P36100	482 aa		2.9	□□□□□ -1.94
EST2	YLR318W	BCK2	P33306	851 aa		2.88	□□□□□ -1.95
EST2	YLR318W	IOC2	Q12072	812 aa		2.88	□□□□□ -1.95
EST2	YLR318W	ULI1	P43604	169 aa		2.87	□□□□□ -1.95
EST2	YLR318W	YAP5	P40574	245 aa		2.87	□□□□□ -1.95
EST2	YLR318W	GTT3	P39996	337 aa		2.85	□□□□□ -1.95
EST2	YLR318W	BDF1	P35817	686 aa		2.83	□□□□□ -1.96
EST2	YLR318W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
EST2	YLR318W	EPS1	P40557	701 aa		2.82	□□□□□ -1.96
EST2	YLR318W	NCR1	Q12200	1170 aa		2.81	□□□□□ -1.96
EST2	YLR318W	RTG1	P32607	177 aa		2.79	□□□□□ -1.96
EST2	YLR318W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
EST2	YLR318W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
EST2	YLR318W	AVT3	P36062	692 aa		2.75	□□□□□ -1.97
EST2	YLR318W	SEC61	P32915	480 aa		2.75	□□□□□ -1.97
EST2	YLR318W	XDJ1	P39102	459 aa		2.75	□□□□□ -1.97
EST2	YLR318W	MSB4	Q12317	492 aa		2.75	□□□□□ -1.97
EST2	YLR318W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EST2	YLR318W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EST2	YLR318W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EST2	YLR318W	PRE3	P38624	215 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EST2	YLR318W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
EST2	YLR318W	SAP30	P38429	201 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EST2	YLR318W	VRP1	P37370	817 aa		2.67	□□□□□ -1.98
EST2	YLR318W	SRC1	Q03707	834 aa		2.66	□□□□□ -1.98
EST2	YLR318W	RIM101	P33400	625 aa		2.65	□□□□□ -1.98
EST2	YLR318W	TAF7	Q05021	590 aa		2.64	□□□□□ -1.99
EST2	YLR318W	SET4	P42948	560 aa		2.64	□□□□□ -1.99
EST2	YLR318W	YDL129W	Q07555	291 aa		2.64	□□□□□ -1.99
EST2	YLR318W	YOL036W	Q08206	761 aa		2.64	□□□□□ -1.99
EST2	YLR318W	BBC1	P47068	1157 aa		2.62	□□□□□ -1.99
EST2	YLR318W	PIB1	Q06651	286 aa		2.62	□□□□□ -1.99
EST2	YLR318W	JIP4	Q03361	876 aa		2.58	□□□□□ -2
EST2	YLR318W	DAN4	P47179	1161 aa		2.58	□□□□□ -2
EST2	YLR318W	YPL062W	Q02781	134 aa		2.58	□□□□□ -2
EST2	YLR318W	DMA1	P38823	416 aa		2.54	□□□□□ -2
EST2	YLR318W	PTP3	P40048	928 aa		2.54	□□□□□ -2
EST2	YLR318W	AI2	P03876	854 aa		2.52	□□□□□ -2.01
EST2	YLR318W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
EST2	YLR318W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
EST2	YLR318W	OXP1	P28273	1286 aa		2.5	□□□□□ -2.01
EST2	YLR318W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
EST2	YLR318W	SAM3	Q08986	587 aa		2.49	□□□□□ -2.01
EST2	YLR318W	PTC4	P38089	393 aa		2.47	□□□□□ -2.01
EST2	YLR318W	RSM7	P47150	247 aa		2.47	□□□□□ -2.01
EST2	YLR318W	YDR344C	Q05510	147 aa		2.47	□□□□□ -2.01
EST2	YLR318W	TRK1	P12685	1235 aa		2.46	□□□□□ -2.02
EST2	YLR318W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
EST2	YLR318W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
EST2	YLR318W	HTA2	P04912	132 aa		2.45	□□□□□ -2.02

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