RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
TTI1	YKL033W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TTI1	YKL033W	FAP1	P53971	965 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TTI1	YKL033W	PRY3	P47033	881 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TTI1	YKL033W	PRI1	P10363	409 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TTI1	YKL033W	AAD16	Q02895	342 aa		5.31	□□□□□ -1.56
TTI1	YKL033W	ISW2	Q08773	1120 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTI1	YKL033W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
TTI1	YKL033W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TTI1	YKL033W	YCK3	P39962	524 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TTI1	YKL033W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TTI1	YKL033W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TTI1	YKL033W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TTI1	YKL033W	AVT3	P36062	692 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTI1	YKL033W	MRPL32	P25348	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTI1	YKL033W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTI1	YKL033W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTI1	YKL033W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTI1	YKL033W	REB1	P21538	810 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTI1	YKL033W	YGL015C	P33199	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTI1	YKL033W	CDC27	P38042	758 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI1	YKL033W	SPT21	P35209	758 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI1	YKL033W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TTI1	YKL033W	HO	P09932	586 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TTI1	YKL033W	DCD1	P06773	312 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TTI1	YKL033W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.69
TTI1	YKL033W	TFC8	Q12308	588 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TTI1	YKL033W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
TTI1	YKL033W	RIM101	P33400	625 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TTI1	YKL033W	SCY1	P53009	804 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TTI1	YKL033W	BCH2	P36122	765 aa		4.32	□□□□□ -1.72
TTI1	YKL033W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
TTI1	YKL033W	OXP1	P28273	1286 aa		4.28	□□□□□ -1.72
TTI1	YKL033W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
TTI1	YKL033W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TTI1	YKL033W	PTP3	P40048	928 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TTI1	YKL033W	TGL3	P40308	642 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TTI1	YKL033W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
TTI1	YKL033W	EPS1	P40557	701 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TTI1	YKL033W	BDF1	P35817	686 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TTI1	YKL033W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TTI1	YKL033W	TFA1	P36100	482 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TTI1	YKL033W	RSM7	P47150	247 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TTI1	YKL033W	UBP9	P39967	754 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTI1	YKL033W	AI2	P03876	854 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TTI1	YKL033W	BBC1	P47068	1157 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TTI1	YKL033W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TTI1	YKL033W	YLR271W	Q06152	274 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TTI1	YKL033W	YOR238W	Q08634	303 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TTI1	YKL033W	MST1	P07236	462 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TTI1	YKL033W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TTI1	YKL033W	YAP5	P40574	245 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TTI1	YKL033W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4	□□□□□ -1.77	not detected
TTI1	YKL033W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TTI1	YKL033W	SSP1	P38871	571 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TTI1	YKL033W	WSC3	Q12215	556 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TTI1	YKL033W	MRM1	P25270	412 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TTI1	YKL033W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
TTI1	YKL033W	PIB1	Q06651	286 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TTI1	YKL033W	VNX1	P42839	908 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TTI1	YKL033W	GTT3	P39996	337 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TTI1	YKL033W	SPP1	Q03012	353 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TTI1	YKL033W	CST9	Q06032	482 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TTI1	YKL033W	MGA2	P40578	1113 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TTI1	YKL033W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TTI1	YKL033W	YFR006W	P43590	535 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TTI1	YKL033W	VPS29	P38759	282 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TTI1	YKL033W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TTI1	YKL033W	ULI1	P43604	169 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TTI1	YKL033W	RTG3	P38165	486 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TTI1	YKL033W	RCR1	P38212	213 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TTI1	YKL033W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.85	□□□□□ -1.79	not detected
TTI1	YKL033W	STS1	P38637	319 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TTI1	YKL033W	FKH1	P40466	484 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TTI1	YKL033W	SET4	P42948	560 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TTI1	YKL033W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
TTI1	YKL033W	LDB19	Q12502	818 aa		3.84	□□□□□ -1.8
TTI1	YKL033W	YOL036W	Q08206	761 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TTI1	YKL033W	IOC2	Q12072	812 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TTI1	YKL033W	YJL171C	P46992	396 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTI1	YKL033W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
TTI1	YKL033W	MSB4	Q12317	492 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTI1	YKL033W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTI1	YKL033W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTI1	YKL033W	SAM3	Q08986	587 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTI1	YKL033W	RTG1	P32607	177 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTI1	YKL033W	BMT6	Q12291	365 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TTI1	YKL033W	GYP5	Q12344	894 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTI1	YKL033W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTI1	YKL033W	NCR1	Q12200	1170 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTI1	YKL033W	DCW1	P36091	449 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTI1	YKL033W	RAM2	P29703	316 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	SEC61	P32915	480 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	MIF2	P35201	549 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	HTA2	P04912	132 aa		3.69	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	EDS1	P38073	919 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	SAP30	P38429	201 aa		3.68	□□□□□ -1.82

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