RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
THP2YHR167W FAP1P53971 965 aa12.79□□□□□ -0.36
THP2YHR167W DRS1P32892 752 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
THP2YHR167W PRY3P47033 881 aa12.05□□□□□ -0.48
THP2YHR167W PRI1P10363 409 aa11.79□□□□□ -0.52
THP2YHR167W AAD16Q02895 342 aa11.74□□□□□ -0.53
THP2YHR167W ISW2Q08773 1120 aa11.46□□□□□ -0.57
THP2YHR167W YCK3P39962 524 aa11.42□□□□□ -0.58
THP2YHR167W RPG1P38249 964 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
THP2YHR167W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
THP2YHR167W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
THP2YHR167W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
THP2YHR167W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
THP2YHR167W MRPL32P25348 183 aa10.66□□□□□ -0.7
THP2YHR167W AVT3P36062 692 aa10.65□□□□□ -0.7
THP2YHR167W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
THP2YHR167W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
THP2YHR167W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
THP2YHR167W REB1P21538 810 aa10.5□□□□□ -0.73
THP2YHR167W YGL015CP33199 130 aa10.25□□□□□ -0.77
THP2YHR167W CDC27P38042 758 aa10.17□□□□□ -0.78
THP2YHR167W SPT21P35209 758 aa10.09□□□□□ -0.79
THP2YHR167W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
THP2YHR167W TFA1P36100 482 aa9.95□□□□□ -0.82
THP2YHR167W DCD1P06773 312 aa9.88□□□□□ -0.83
THP2YHR167W MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
THP2YHR167W HOP09932 586 aa9.86□□□□□ -0.83
THP2YHR167W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
THP2YHR167W TFC8Q12308 588 aa9.81□□□□□ -0.84
THP2YHR167W SCY1P53009 804 aa9.62□□□□□ -0.87
THP2YHR167W RIM101P33400 625 aa9.61□□□□□ -0.87
THP2YHR167W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
THP2YHR167W BCH2P36122 765 aa9.49□□□□□ -0.89
THP2YHR167W SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
THP2YHR167W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
THP2YHR167W TGL3P40308 642 aa9.34□□□□□ -0.91
THP2YHR167W OXP1P28273 1286 aa9.33□□□□□ -0.92
THP2YHR167W EPS1P40557 701 aa9.24□□□□□ -0.93
THP2YHR167W BDF1P35817 686 aa9.19□□□□□ -0.94
THP2YHR167W PTP3P40048 928 aa9.19□□□□□ -0.94
THP2YHR167W UBP9P39967 754 aa9.13□□□□□ -0.95
THP2YHR167W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
THP2YHR167W SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
THP2YHR167W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
THP2YHR167W RSM7P47150 247 aa9□□□□□ -0.97
THP2YHR167W AI2P03876 854 aa8.97□□□□□ -0.97
THP2YHR167W BBC1P47068 1157 aa8.95□□□□□ -0.98
THP2YHR167W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.93□□□□□ -0.98
THP2YHR167W MST1P07236 462 aa8.92□□□□□ -0.98
THP2YHR167W YOR238WQ08634 303 aa8.9□□□□□ -0.98
THP2YHR167W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.85□□□□□ -0.99not detected
THP2YHR167W YLR271WQ06152 274 aa8.84□□□□□ -0.99
THP2YHR167W YAP5P40574 245 aa8.81□□□□□ -1
THP2YHR167W VNX1P42839 908 aa8.76□□□□□ -1.01
THP2YHR167W WSC3Q12215 556 aa8.76□□□□□ -1.01
THP2YHR167W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
THP2YHR167W SPP1Q03012 353 aa8.68□□□□□ -1.02
THP2YHR167W PIB1Q06651 286 aa8.68□□□□□ -1.02
THP2YHR167W MRM1P25270 412 aa8.66□□□□□ -1.02
THP2YHR167W SSP1P38871 571 aa8.66□□□□□ -1.02
THP2YHR167W GTT3P39996 337 aa8.64□□□□□ -1.03
THP2YHR167W TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
THP2YHR167W CST9Q06032 482 aa8.55□□□□□ -1.04
THP2YHR167W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.55□□□□□ -1.04not detected
THP2YHR167W FKH1P40466 484 aa8.54□□□□□ -1.04
THP2YHR167W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
THP2YHR167W LDB19Q12502 818 aa8.48□□□□□ -1.05
THP2YHR167W ULI1P43604 169 aa8.47□□□□□ -1.05
THP2YHR167W YFR006WP43590 535 aa8.45□□□□□ -1.06
THP2YHR167W VPS29P38759 282 aa8.44□□□□□ -1.06
THP2YHR167W IOC2Q12072 812 aa8.44□□□□□ -1.06
THP2YHR167W DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
THP2YHR167W MGA2P40578 1113 aa8.42□□□□□ -1.06
THP2YHR167W STS1P38637 319 aa8.41□□□□□ -1.06
THP2YHR167W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.41□□□□□ -1.06not detected
THP2YHR167W YOL036WQ08206 761 aa8.41□□□□□ -1.06
THP2YHR167W RCR1P38212 213 aa8.4□□□□□ -1.06
THP2YHR167W SET4P42948 560 aa8.4□□□□□ -1.06
THP2YHR167W YJL171CP46992 396 aa8.4□□□□□ -1.06
THP2YHR167W RTG3P38165 486 aa8.38□□□□□ -1.07
THP2YHR167W MSB4Q12317 492 aa8.37□□□□□ -1.07
THP2YHR167W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
THP2YHR167W TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
THP2YHR167W RTG1P32607 177 aa8.3□□□□□ -1.08
THP2YHR167W EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
THP2YHR167W BMT6Q12291 365 aa8.3□□□□□ -1.08
THP2YHR167W SAM3Q08986 587 aa8.26□□□□□ -1.09
THP2YHR167W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
THP2YHR167W NCR1Q12200 1170 aa8.19□□□□□ -1.1
THP2YHR167W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
THP2YHR167W SEC61P32915 480 aa8.15□□□□□ -1.1
THP2YHR167W GYP5Q12344 894 aa8.14□□□□□ -1.11
THP2YHR167W DCW1P36091 449 aa8.12□□□□□ -1.11
THP2YHR167W DMA1P38823 416 aa8.12□□□□□ -1.11
THP2YHR167W DAN4P47179 1161 aa8.11□□□□□ -1.11
THP2YHR167W HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
THP2YHR167W HTA2P04912 132 aa8.08□□□□□ -1.12
THP2YHR167W SAP30P38429 201 aa8.08□□□□□ -1.12
THP2YHR167W ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
THP2YHR167W JIP4Q03361 876 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.8 ms