RNA–Protein interactions for RNA: YHR063W-A

YHR063W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YHR063W-A, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR063W-AYHR063W-A MTC1P47018 478 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
YHR063W-AYHR063W-A FAP1P53971 965 aa12.15□□□□□ -0.46
YHR063W-AYHR063W-A PRY3P47033 881 aa11.45□□□□□ -0.58
YHR063W-AYHR063W-A DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
YHR063W-AYHR063W-A AAD16Q02895 342 aa11.07□□□□□ -0.64
YHR063W-AYHR063W-A PRI1P10363 409 aa11.06□□□□□ -0.64
YHR063W-AYHR063W-A YCK3P39962 524 aa10.78□□□□□ -0.68
YHR063W-AYHR063W-A ISW2Q08773 1120 aa10.68□□□□□ -0.7
YHR063W-AYHR063W-A HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
YHR063W-AYHR063W-A RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
YHR063W-AYHR063W-A TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
YHR063W-AYHR063W-A DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
YHR063W-AYHR063W-A MRPL32P25348 183 aa10.03□□□□□ -0.8
YHR063W-AYHR063W-A RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
YHR063W-AYHR063W-A YGL015CP33199 130 aa9.76□□□□□ -0.85
YHR063W-AYHR063W-A REB1P21538 810 aa9.7□□□□□ -0.86
YHR063W-AYHR063W-A RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
YHR063W-AYHR063W-A RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
YHR063W-AYHR063W-A AVT3P36062 692 aa9.59□□□□□ -0.87
YHR063W-AYHR063W-A CDC27P38042 758 aa9.43□□□□□ -0.9
YHR063W-AYHR063W-A YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
YHR063W-AYHR063W-A BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
YHR063W-AYHR063W-A SPT21P35209 758 aa9.21□□□□□ -0.94
YHR063W-AYHR063W-A MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
YHR063W-AYHR063W-A UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
YHR063W-AYHR063W-A BFR2Q06631 534 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
YHR063W-AYHR063W-A HOP09932 586 aa9.09□□□□□ -0.95
YHR063W-AYHR063W-A DCD1P06773 312 aa9.07□□□□□ -0.96
YHR063W-AYHR063W-A TFC8Q12308 588 aa9.06□□□□□ -0.96
YHR063W-AYHR063W-A SCY1P53009 804 aa8.92□□□□□ -0.98
YHR063W-AYHR063W-A TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
YHR063W-AYHR063W-A SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YHR063W-AYHR063W-A TGL3P40308 642 aa8.81□□□□□ -1
YHR063W-AYHR063W-A RIM101P33400 625 aa8.76□□□□□ -1.01
YHR063W-AYHR063W-A BCH2P36122 765 aa8.75□□□□□ -1.01
YHR063W-AYHR063W-A SIS1P25294 352 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YHR063W-AYHR063W-A UBP9P39967 754 aa8.72□□□□□ -1.01
YHR063W-AYHR063W-A EPS1P40557 701 aa8.49□□□□□ -1.05
YHR063W-AYHR063W-A BDF1P35817 686 aa8.47□□□□□ -1.05
YHR063W-AYHR063W-A OXP1P28273 1286 aa8.46□□□□□ -1.06
YHR063W-AYHR063W-A PTP3P40048 928 aa8.37□□□□□ -1.07
YHR063W-AYHR063W-A YBL029C-AQ3E756 94 aa8.36□□□□□ -1.07
YHR063W-AYHR063W-A MST1P07236 462 aa8.35□□□□□ -1.07
YHR063W-AYHR063W-A YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YHR063W-AYHR063W-A YOR238WQ08634 303 aa8.32□□□□□ -1.08
YHR063W-AYHR063W-A BBC1P47068 1157 aa8.23□□□□□ -1.09
YHR063W-AYHR063W-A VNX1P42839 908 aa8.22□□□□□ -1.09
YHR063W-AYHR063W-A NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.21□□□□□ -1.1not detected
YHR063W-AYHR063W-A RSM7P47150 247 aa8.21□□□□□ -1.1
YHR063W-AYHR063W-A AI2P03876 854 aa8.19□□□□□ -1.1
YHR063W-AYHR063W-A YAP5P40574 245 aa8.19□□□□□ -1.1
YHR063W-AYHR063W-A WSC3Q12215 556 aa8.17□□□□□ -1.1
YHR063W-AYHR063W-A SPP1Q03012 353 aa8.16□□□□□ -1.1
YHR063W-AYHR063W-A YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YHR063W-AYHR063W-A TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
YHR063W-AYHR063W-A GTT3P39996 337 aa8.03□□□□□ -1.12
YHR063W-AYHR063W-A AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
YHR063W-AYHR063W-A FKH1P40466 484 aa8□□□□□ -1.13
YHR063W-AYHR063W-A YJL171CP46992 396 aa7.99□□□□□ -1.13
YHR063W-AYHR063W-A YLR271WQ06152 274 aa7.97□□□□□ -1.13
YHR063W-AYHR063W-A PIB1Q06651 286 aa7.96□□□□□ -1.14
YHR063W-AYHR063W-A LDB19Q12502 818 aa7.92□□□□□ -1.14
YHR063W-AYHR063W-A ULI1P43604 169 aa7.91□□□□□ -1.14
YHR063W-AYHR063W-A PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
YHR063W-AYHR063W-A IOC2Q12072 812 aa7.88□□□□□ -1.15
YHR063W-AYHR063W-A MRM1P25270 412 aa7.87□□□□□ -1.15
YHR063W-AYHR063W-A BMT6Q12291 365 aa7.83□□□□□ -1.16
YHR063W-AYHR063W-A TFA1P36100 482 aa7.81□□□□□ -1.16
YHR063W-AYHR063W-A MSB4Q12317 492 aa7.78□□□□□ -1.16
YHR063W-AYHR063W-A EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
YHR063W-AYHR063W-A SET4P42948 560 aa7.75□□□□□ -1.17
YHR063W-AYHR063W-A YOL036WQ08206 761 aa7.75□□□□□ -1.17
YHR063W-AYHR063W-A RTG1P32607 177 aa7.74□□□□□ -1.17
YHR063W-AYHR063W-A TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
YHR063W-AYHR063W-A ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.72□□□□□ -1.17not detected
YHR063W-AYHR063W-A YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.71□□□□□ -1.18not detected
YHR063W-AYHR063W-A DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
YHR063W-AYHR063W-A SSP1P38871 571 aa7.7□□□□□ -1.18
YHR063W-AYHR063W-A VPS29P38759 282 aa7.69□□□□□ -1.18
YHR063W-AYHR063W-A YFR006WP43590 535 aa7.69□□□□□ -1.18
YHR063W-AYHR063W-A NCR1Q12200 1170 aa7.69□□□□□ -1.18
YHR063W-AYHR063W-A CST9Q06032 482 aa7.66□□□□□ -1.18
YHR063W-AYHR063W-A VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
YHR063W-AYHR063W-A RTG3P38165 486 aa7.64□□□□□ -1.19
YHR063W-AYHR063W-A YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
YHR063W-AYHR063W-A STS1P38637 319 aa7.63□□□□□ -1.19
YHR063W-AYHR063W-A SEC61P32915 480 aa7.62□□□□□ -1.19
YHR063W-AYHR063W-A SAM3Q08986 587 aa7.6□□□□□ -1.19
YHR063W-AYHR063W-A MGA2P40578 1113 aa7.58□□□□□ -1.2
YHR063W-AYHR063W-A TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
YHR063W-AYHR063W-A RCR1P38212 213 aa7.54□□□□□ -1.2
YHR063W-AYHR063W-A SAP30P38429 201 aa7.52□□□□□ -1.21
YHR063W-AYHR063W-A DAN4P47179 1161 aa7.51□□□□□ -1.21
YHR063W-AYHR063W-A GYP5Q12344 894 aa7.49□□□□□ -1.21
YHR063W-AYHR063W-A JIP4Q03361 876 aa7.48□□□□□ -1.21
YHR063W-AYHR063W-A ABP1P15891 592 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
YHR063W-AYHR063W-A DCW1P36091 449 aa7.45□□□□□ -1.22
YHR063W-AYHR063W-A YDL129WQ07555 291 aa7.45□□□□□ -1.22
YHR063W-AYHR063W-A HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
YHR063W-AYHR063W-A HTA2P04912 132 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms