RNA–Protein interactions for RNA: YGR069W

YGR069W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YGR069W, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR069WYGR069W FAP1P53971 965 aa13.76□□□□□ -0.21
YGR069WYGR069W MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
YGR069WYGR069W PRY3P47033 881 aa12.98□□□□□ -0.33
YGR069WYGR069W AAD16Q02895 342 aa12.35□□□□□ -0.43
YGR069WYGR069W PRI1P10363 409 aa12.24□□□□□ -0.45
YGR069WYGR069W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
YGR069WYGR069W YCK3P39962 524 aa12.17□□□□□ -0.46
YGR069WYGR069W ISW2Q08773 1120 aa11.59□□□□□ -0.55
YGR069WYGR069W RPG1P38249 964 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
YGR069WYGR069W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
YGR069WYGR069W DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
YGR069WYGR069W MRPL32P25348 183 aa11.06□□□□□ -0.64
YGR069WYGR069W YGL015CP33199 130 aa11.04□□□□□ -0.64
YGR069WYGR069W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
YGR069WYGR069W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
YGR069WYGR069W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
YGR069WYGR069W REB1P21538 810 aa10.25□□□□□ -0.77
YGR069WYGR069W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
YGR069WYGR069W CDC27P38042 758 aa10.17□□□□□ -0.78
YGR069WYGR069W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
YGR069WYGR069W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
YGR069WYGR069W SIS1P25294 352 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
YGR069WYGR069W MAP2P38174 421 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
YGR069WYGR069W UBP9P39967 754 aa9.95□□□□□ -0.82
YGR069WYGR069W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
YGR069WYGR069W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
YGR069WYGR069W TGL3P40308 642 aa9.79□□□□□ -0.84
YGR069WYGR069W TFC8Q12308 588 aa9.65□□□□□ -0.86
YGR069WYGR069W SPT21P35209 758 aa9.62□□□□□ -0.87
YGR069WYGR069W SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
YGR069WYGR069W SCY1P53009 804 aa9.58□□□□□ -0.88
YGR069WYGR069W HOP09932 586 aa9.57□□□□□ -0.88
YGR069WYGR069W AVT3P36062 692 aa9.56□□□□□ -0.88
YGR069WYGR069W DCD1P06773 312 aa9.53□□□□□ -0.88
YGR069WYGR069W BCH2P36122 765 aa9.25□□□□□ -0.93
YGR069WYGR069W MST1P07236 462 aa9.21□□□□□ -0.94
YGR069WYGR069W YBL029C-AQ3E756 94 aa9.18□□□□□ -0.94
YGR069WYGR069W YOR238WQ08634 303 aa9.08□□□□□ -0.96
YGR069WYGR069W VNX1P42839 908 aa9.07□□□□□ -0.96
YGR069WYGR069W YJL171CP46992 396 aa9□□□□□ -0.97
YGR069WYGR069W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.98□□□□□ -0.97not detected
YGR069WYGR069W RIM101P33400 625 aa8.98□□□□□ -0.97
YGR069WYGR069W SPP1Q03012 353 aa8.98□□□□□ -0.97
YGR069WYGR069W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
YGR069WYGR069W BDF1P35817 686 aa8.93□□□□□ -0.98
YGR069WYGR069W EPS1P40557 701 aa8.92□□□□□ -0.98
YGR069WYGR069W FKH1P40466 484 aa8.91□□□□□ -0.98
YGR069WYGR069W TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YGR069WYGR069W YAP5P40574 245 aa8.82□□□□□ -1
YGR069WYGR069W WSC3Q12215 556 aa8.81□□□□□ -1
YGR069WYGR069W BMT6Q12291 365 aa8.75□□□□□ -1.01
YGR069WYGR069W LDB19Q12502 818 aa8.66□□□□□ -1.02
YGR069WYGR069W GTT3P39996 337 aa8.65□□□□□ -1.02
YGR069WYGR069W IOC2Q12072 812 aa8.61□□□□□ -1.03
YGR069WYGR069W ULI1P43604 169 aa8.6□□□□□ -1.03
YGR069WYGR069W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
YGR069WYGR069W OXP1P28273 1286 aa8.58□□□□□ -1.04
YGR069WYGR069W BBC1P47068 1157 aa8.58□□□□□ -1.04
YGR069WYGR069W PTP3P40048 928 aa8.54□□□□□ -1.04
YGR069WYGR069W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
YGR069WYGR069W EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
YGR069WYGR069W MSB4Q12317 492 aa8.46□□□□□ -1.06
YGR069WYGR069W AI2P03876 854 aa8.42□□□□□ -1.06
YGR069WYGR069W RSM7P47150 247 aa8.4□□□□□ -1.06
YGR069WYGR069W RTG1P32607 177 aa8.39□□□□□ -1.07
YGR069WYGR069W NCR1Q12200 1170 aa8.39□□□□□ -1.07
YGR069WYGR069W SEC61P32915 480 aa8.34□□□□□ -1.07
YGR069WYGR069W BCK2P33306 851 aa8.31□□□□□ -1.08
YGR069WYGR069W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YGR069WYGR069W TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YGR069WYGR069W PIB1Q06651 286 aa8.26□□□□□ -1.09
YGR069WYGR069W YOL036WQ08206 761 aa8.24□□□□□ -1.09
YGR069WYGR069W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
YGR069WYGR069W SET4P42948 560 aa8.2□□□□□ -1.1
YGR069WYGR069W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
YGR069WYGR069W RGA2Q06407 1009 aa8.19□□□□□ -1.1
YGR069WYGR069W SAP30P38429 201 aa8.12□□□□□ -1.11
YGR069WYGR069W PRE3P38624 215 aa8.09□□□□□ -1.11
YGR069WYGR069W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
YGR069WYGR069W JIP4Q03361 876 aa8.07□□□□□ -1.12
YGR069WYGR069W YDL129WQ07555 291 aa8.07□□□□□ -1.12
YGR069WYGR069W XDJ1P39102 459 aa8.05□□□□□ -1.12
YGR069WYGR069W DAN4P47179 1161 aa8.05□□□□□ -1.12
YGR069WYGR069W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
YGR069WYGR069W SAM3Q08986 587 aa8.04□□□□□ -1.12
YGR069WYGR069W MRM1P25270 412 aa8.01□□□□□ -1.13
YGR069WYGR069W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8□□□□□ -1.13not detected
YGR069WYGR069W ABP1P15891 592 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YGR069WYGR069W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
YGR069WYGR069W DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YGR069WYGR069W YLR271WQ06152 274 aa7.95□□□□□ -1.14
YGR069WYGR069W VRP1P37370 817 aa7.93□□□□□ -1.14
YGR069WYGR069W DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
YGR069WYGR069W RGA1P39083 1007 aa7.92□□□□□ -1.14
YGR069WYGR069W PTC4P38089 393 aa7.88□□□□□ -1.15
YGR069WYGR069W VPS29P38759 282 aa7.88□□□□□ -1.15
YGR069WYGR069W HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
YGR069WYGR069W HTA2P04912 132 aa7.86□□□□□ -1.15
YGR069WYGR069W YFR006WP43590 535 aa7.85□□□□□ -1.15
YGR069WYGR069W STS1P38637 319 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.8 ms