RNA–Protein interactions for RNA: YFR057W

YFR057W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YFR057W, Length 456 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR057WYFR057W MTC1P47018 478 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
YFR057WYFR057W DRS1P32892 752 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
YFR057WYFR057W FAP1P53971 965 aa15.86■□□□□ 0.13
YFR057WYFR057W PRY3P47033 881 aa14.89□□□□□ -0.03
YFR057WYFR057W PRI1P10363 409 aa14.7□□□□□ -0.06
YFR057WYFR057W AAD16Q02895 342 aa14.65□□□□□ -0.06
YFR057WYFR057W ISW2Q08773 1120 aa14.42□□□□□ -0.1
YFR057WYFR057W RPG1P38249 964 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
YFR057WYFR057W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
YFR057WYFR057W YCK3P39962 524 aa13.96□□□□□ -0.17
YFR057WYFR057W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
YFR057WYFR057W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
YFR057WYFR057W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
YFR057WYFR057W AVT3P36062 692 aa13.46□□□□□ -0.25
YFR057WYFR057W MRPL32P25348 183 aa13.38□□□□□ -0.27
YFR057WYFR057W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
YFR057WYFR057W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
YFR057WYFR057W REB1P21538 810 aa13.24□□□□□ -0.29
YFR057WYFR057W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
YFR057WYFR057W YGL015CP33199 130 aa12.89□□□□□ -0.35
YFR057WYFR057W CDC27P38042 758 aa12.62□□□□□ -0.39
YFR057WYFR057W SPT21P35209 758 aa12.6□□□□□ -0.39
YFR057WYFR057W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
YFR057WYFR057W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
YFR057WYFR057W HOP09932 586 aa12.3□□□□□ -0.44
YFR057WYFR057W TFC8Q12308 588 aa12.29□□□□□ -0.44
YFR057WYFR057W MAP2P38174 421 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
YFR057WYFR057W DCD1P06773 312 aa12.25□□□□□ -0.45
YFR057WYFR057W RIM101P33400 625 aa12.14□□□□□ -0.47
YFR057WYFR057W SCY1P53009 804 aa12□□□□□ -0.49
YFR057WYFR057W BCH2P36122 765 aa11.88□□□□□ -0.51
YFR057WYFR057W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
YFR057WYFR057W SLX5P32828 619 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
YFR057WYFR057W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
YFR057WYFR057W TGL3P40308 642 aa11.77□□□□□ -0.53
YFR057WYFR057W OXP1P28273 1286 aa11.72□□□□□ -0.53
YFR057WYFR057W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
YFR057WYFR057W PTP3P40048 928 aa11.6□□□□□ -0.55
YFR057WYFR057W EPS1P40557 701 aa11.58□□□□□ -0.56
YFR057WYFR057W BDF1P35817 686 aa11.53□□□□□ -0.56
YFR057WYFR057W UBP9P39967 754 aa11.51□□□□□ -0.57
YFR057WYFR057W TFA1P36100 482 aa11.44□□□□□ -0.58
YFR057WYFR057W RSM7P47150 247 aa11.41□□□□□ -0.58
YFR057WYFR057W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
YFR057WYFR057W BBC1P47068 1157 aa11.37□□□□□ -0.59
YFR057WYFR057W SIS1P25294 352 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
YFR057WYFR057W AI2P03876 854 aa11.32□□□□□ -0.6
YFR057WYFR057W MST1P07236 462 aa11.22□□□□□ -0.61
YFR057WYFR057W YOR238WQ08634 303 aa11.22□□□□□ -0.61
YFR057WYFR057W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data11.16□□□□□ -0.62not detected
YFR057WYFR057W YLR271WQ06152 274 aa11.16□□□□□ -0.62
YFR057WYFR057W YAP5P40574 245 aa11.11□□□□□ -0.63
YFR057WYFR057W YBL029C-AQ3E756 94 aa11.09□□□□□ -0.63
YFR057WYFR057W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
YFR057WYFR057W SSP1P38871 571 aa10.99□□□□□ -0.65
YFR057WYFR057W VNX1P42839 908 aa10.98□□□□□ -0.65
YFR057WYFR057W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data10.97□□□□□ -0.65not detected
YFR057WYFR057W WSC3Q12215 556 aa10.93□□□□□ -0.66
YFR057WYFR057W MRM1P25270 412 aa10.91□□□□□ -0.66
YFR057WYFR057W GTT3P39996 337 aa10.9□□□□□ -0.66
YFR057WYFR057W SPP1Q03012 353 aa10.9□□□□□ -0.66
YFR057WYFR057W PIB1Q06651 286 aa10.82□□□□□ -0.68
YFR057WYFR057W TIF11P38912 153 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
YFR057WYFR057W MGA2P40578 1113 aa10.75□□□□□ -0.69
YFR057WYFR057W CST9Q06032 482 aa10.75□□□□□ -0.69
YFR057WYFR057W RTG3P38165 486 aa10.67□□□□□ -0.7
YFR057WYFR057W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data10.67□□□□□ -0.7not detected
YFR057WYFR057W ULI1P43604 169 aa10.65□□□□□ -0.7
YFR057WYFR057W VPS29P38759 282 aa10.64□□□□□ -0.71
YFR057WYFR057W DBP1P24784 617 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
YFR057WYFR057W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
YFR057WYFR057W FKH1P40466 484 aa10.61□□□□□ -0.71
YFR057WYFR057W YJL171CP46992 396 aa10.61□□□□□ -0.71
YFR057WYFR057W LDB19Q12502 818 aa10.61□□□□□ -0.71
YFR057WYFR057W MSB4Q12317 492 aa10.6□□□□□ -0.71
YFR057WYFR057W YFR006WP43590 535 aa10.59□□□□□ -0.71
YFR057WYFR057W IOC2Q12072 812 aa10.58□□□□□ -0.72
YFR057WYFR057W EAP1P36041 632 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
YFR057WYFR057W STS1P38637 319 aa10.54□□□□□ -0.72
YFR057WYFR057W SET4P42948 560 aa10.54□□□□□ -0.72
YFR057WYFR057W YOL036WQ08206 761 aa10.54□□□□□ -0.72
YFR057WYFR057W RCR1P38212 213 aa10.51□□□□□ -0.73
YFR057WYFR057W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
YFR057WYFR057W TRP5P00931 707 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
YFR057WYFR057W BMT6Q12291 365 aa10.44□□□□□ -0.74
YFR057WYFR057W SAM3Q08986 587 aa10.43□□□□□ -0.74
YFR057WYFR057W RTG1P32607 177 aa10.42□□□□□ -0.74
YFR057WYFR057W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
YFR057WYFR057W NCR1Q12200 1170 aa10.36□□□□□ -0.75
YFR057WYFR057W SEC61P32915 480 aa10.32□□□□□ -0.76
YFR057WYFR057W GYP5Q12344 894 aa10.31□□□□□ -0.76
YFR057WYFR057W ABP1P15891 592 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
YFR057WYFR057W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
YFR057WYFR057W DCW1P36091 449 aa10.24□□□□□ -0.77
YFR057WYFR057W JIP4Q03361 876 aa10.24□□□□□ -0.77
YFR057WYFR057W HTA1P04911 132 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
YFR057WYFR057W HTA2P04912 132 aa10.23□□□□□ -0.77
YFR057WYFR057W DAN4P47179 1161 aa10.2□□□□□ -0.78
YFR057WYFR057W MAK11P20484 414 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
YFR057WYFR057W RAM2P29703 316 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 148.6 ms