RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W MTC1P47018 478 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NSE4YDL105W FAP1P53971 965 aa14.96□□□□□ -0.01
NSE4YDL105W DRS1P32892 752 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NSE4YDL105W PRY3P47033 881 aa14.05□□□□□ -0.16
NSE4YDL105W PRI1P10363 409 aa13.78□□□□□ -0.2
NSE4YDL105W AAD16Q02895 342 aa13.77□□□□□ -0.21
NSE4YDL105W ISW2Q08773 1120 aa13.44□□□□□ -0.26
NSE4YDL105W RPG1P38249 964 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NSE4YDL105W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
NSE4YDL105W YCK3P39962 524 aa13.17□□□□□ -0.3
NSE4YDL105W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NSE4YDL105W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NSE4YDL105W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
NSE4YDL105W MRPL32P25348 183 aa12.53□□□□□ -0.4
NSE4YDL105W AVT3P36062 692 aa12.28□□□□□ -0.44
NSE4YDL105W REB1P21538 810 aa12.24□□□□□ -0.45
NSE4YDL105W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
NSE4YDL105W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
NSE4YDL105W YGL015CP33199 130 aa12.17□□□□□ -0.46
NSE4YDL105W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
NSE4YDL105W CDC27P38042 758 aa11.74□□□□□ -0.53
NSE4YDL105W SPT21P35209 758 aa11.64□□□□□ -0.55
NSE4YDL105W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NSE4YDL105W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
NSE4YDL105W MAP2P38174 421 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NSE4YDL105W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NSE4YDL105W TFC8Q12308 588 aa11.39□□□□□ -0.59
NSE4YDL105W HOP09932 586 aa11.36□□□□□ -0.59
NSE4YDL105W DCD1P06773 312 aa11.29□□□□□ -0.6
NSE4YDL105W RIM101P33400 625 aa11.16□□□□□ -0.62
NSE4YDL105W SCY1P53009 804 aa11.14□□□□□ -0.63
NSE4YDL105W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
NSE4YDL105W SLX5P32828 619 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
NSE4YDL105W TGL3P40308 642 aa11.06□□□□□ -0.64
NSE4YDL105W BCH2P36122 765 aa10.99□□□□□ -0.65
NSE4YDL105W UBP9P39967 754 aa10.9□□□□□ -0.66
NSE4YDL105W SIS1P25294 352 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
NSE4YDL105W OXP1P28273 1286 aa10.72□□□□□ -0.69
NSE4YDL105W EPS1P40557 701 aa10.69□□□□□ -0.7
NSE4YDL105W BDF1P35817 686 aa10.66□□□□□ -0.7
NSE4YDL105W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
NSE4YDL105W PTP3P40048 928 aa10.63□□□□□ -0.71
NSE4YDL105W MST1P07236 462 aa10.52□□□□□ -0.73
NSE4YDL105W BBC1P47068 1157 aa10.49□□□□□ -0.73
NSE4YDL105W YOR238WQ08634 303 aa10.48□□□□□ -0.73
NSE4YDL105W RSM7P47150 247 aa10.47□□□□□ -0.73
NSE4YDL105W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data10.45□□□□□ -0.74not detected
NSE4YDL105W AI2P03876 854 aa10.4□□□□□ -0.74
NSE4YDL105W YBL029C-AQ3E756 94 aa10.38□□□□□ -0.75
NSE4YDL105W YAP5P40574 245 aa10.35□□□□□ -0.75
NSE4YDL105W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
NSE4YDL105W TFA1P36100 482 aa10.34□□□□□ -0.75
NSE4YDL105W VNX1P42839 908 aa10.28□□□□□ -0.76
NSE4YDL105W SPP1Q03012 353 aa10.21□□□□□ -0.77
NSE4YDL105W YLR271WQ06152 274 aa10.16□□□□□ -0.78
NSE4YDL105W WSC3Q12215 556 aa10.16□□□□□ -0.78
NSE4YDL105W GTT3P39996 337 aa10.13□□□□□ -0.79
NSE4YDL105W TIF11P38912 153 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NSE4YDL105W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NSE4YDL105W YJL171CP46992 396 aa10□□□□□ -0.81
NSE4YDL105W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
NSE4YDL105W MRM1P25270 412 aa9.99□□□□□ -0.81
NSE4YDL105W FKH1P40466 484 aa9.99□□□□□ -0.81
NSE4YDL105W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data9.99□□□□□ -0.81not detected
NSE4YDL105W SSP1P38871 571 aa9.95□□□□□ -0.82
NSE4YDL105W PIB1Q06651 286 aa9.94□□□□□ -0.82
NSE4YDL105W ULI1P43604 169 aa9.93□□□□□ -0.82
NSE4YDL105W LDB19Q12502 818 aa9.92□□□□□ -0.82
NSE4YDL105W IOC2Q12072 812 aa9.9□□□□□ -0.82
NSE4YDL105W MSB4Q12317 492 aa9.9□□□□□ -0.82
NSE4YDL105W EAP1P36041 632 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
NSE4YDL105W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.83□□□□□ -0.84not detected
NSE4YDL105W BMT6Q12291 365 aa9.81□□□□□ -0.84
NSE4YDL105W RTG3P38165 486 aa9.79□□□□□ -0.84
NSE4YDL105W MGA2P40578 1113 aa9.79□□□□□ -0.84
NSE4YDL105W VPS29P38759 282 aa9.77□□□□□ -0.85
NSE4YDL105W YOL036WQ08206 761 aa9.77□□□□□ -0.85
NSE4YDL105W DBP1P24784 617 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NSE4YDL105W CST9Q06032 482 aa9.76□□□□□ -0.85
NSE4YDL105W SET4P42948 560 aa9.75□□□□□ -0.85
NSE4YDL105W TRP5P00931 707 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
NSE4YDL105W RTG1P32607 177 aa9.71□□□□□ -0.86
NSE4YDL105W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
NSE4YDL105W YFR006WP43590 535 aa9.69□□□□□ -0.86
NSE4YDL105W SAM3Q08986 587 aa9.68□□□□□ -0.86
NSE4YDL105W NCR1Q12200 1170 aa9.68□□□□□ -0.86
NSE4YDL105W SEC61P32915 480 aa9.66□□□□□ -0.86
NSE4YDL105W STS1P38637 319 aa9.66□□□□□ -0.86
NSE4YDL105W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
NSE4YDL105W ABP1P15891 592 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
NSE4YDL105W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
NSE4YDL105W RCR1P38212 213 aa9.56□□□□□ -0.88
NSE4YDL105W JIP4Q03361 876 aa9.54□□□□□ -0.88
NSE4YDL105W GYP5Q12344 894 aa9.52□□□□□ -0.89
NSE4YDL105W DAN4P47179 1161 aa9.49□□□□□ -0.89
NSE4YDL105W HTA1P04911 132 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NSE4YDL105W HTA2P04912 132 aa9.48□□□□□ -0.89
NSE4YDL105W SAP30P38429 201 aa9.44□□□□□ -0.9
NSE4YDL105W YDL129WQ07555 291 aa9.43□□□□□ -0.9
NSE4YDL105W DCW1P36091 449 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.4 ms