RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0143Q0143 FAP1P53971 965 aa15.24■□□□□ 0.03
Q0143Q0143 PRY3P47033 881 aa14.39□□□□□ -0.11
Q0143Q0143 MTC1P47018 478 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
Q0143Q0143 AAD16Q02895 342 aa13.42□□□□□ -0.26
Q0143Q0143 YCK3P39962 524 aa13.41□□□□□ -0.26
Q0143Q0143 HAA1Q12753 694 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Q0143Q0143 PRI1P10363 409 aa13.23□□□□□ -0.29
Q0143Q0143 TSR3Q12094 313 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Q0143Q0143 ISW2Q08773 1120 aa12.39□□□□□ -0.43
Q0143Q0143 RPG1P38249 964 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
Q0143Q0143 YGL015CP33199 130 aa12.02□□□□□ -0.49
Q0143Q0143 MRPL32P25348 183 aa11.97□□□□□ -0.49
Q0143Q0143 BUD31P25337 157 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
Q0143Q0143 DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
Q0143Q0143 SIS1P25294 352 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Q0143Q0143 RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Q0143Q0143 CDC27P38042 758 aa10.96□□□□□ -0.65
Q0143Q0143 REB1P21538 810 aa10.93□□□□□ -0.66
Q0143Q0143 UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
Q0143Q0143 MAP2P38174 421 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
Q0143Q0143 UBP9P39967 754 aa10.81□□□□□ -0.68
Q0143Q0143 DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
Q0143Q0143 RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Q0143Q0143 RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Q0143Q0143 TIF4632P39936 914 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
Q0143Q0143 TGL3P40308 642 aa10.49□□□□□ -0.73
Q0143Q0143 YKR023WP36119 530 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Q0143Q0143 SCY1P53009 804 aa10.31□□□□□ -0.76
Q0143Q0143 SLX5P32828 619 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
Q0143Q0143 DCD1P06773 312 aa10.29□□□□□ -0.76
Q0143Q0143 HOP09932 586 aa10.28□□□□□ -0.76
Q0143Q0143 TFC8Q12308 588 aa10.24□□□□□ -0.77
Q0143Q0143 SPT21P35209 758 aa10.09□□□□□ -0.79
Q0143Q0143 YBL029C-AQ3E756 94 aa9.98□□□□□ -0.81
Q0143Q0143 BCH2P36122 765 aa9.85□□□□□ -0.83
Q0143Q0143 AVT3P36062 692 aa9.8□□□□□ -0.84
Q0143Q0143 MST1P07236 462 aa9.78□□□□□ -0.84
Q0143Q0143 YJL171CP46992 396 aa9.78□□□□□ -0.84
Q0143Q0143 VNX1P42839 908 aa9.77□□□□□ -0.85
Q0143Q0143 SPP1Q03012 353 aa9.72□□□□□ -0.85
Q0143Q0143 YOR238WQ08634 303 aa9.69□□□□□ -0.86
Q0143Q0143 AIR2Q12476 344 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Q0143Q0143 FKH1P40466 484 aa9.57□□□□□ -0.88
Q0143Q0143 WSC3Q12215 556 aa9.55□□□□□ -0.88
Q0143Q0143 BDF1P35817 686 aa9.47□□□□□ -0.89
Q0143Q0143 EPS1P40557 701 aa9.46□□□□□ -0.9
Q0143Q0143 TIF11P38912 153 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
Q0143Q0143 BMT6Q12291 365 aa9.44□□□□□ -0.9
Q0143Q0143 NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data9.38□□□□□ -0.91not detected
Q0143Q0143 YAP5P40574 245 aa9.35□□□□□ -0.91
Q0143Q0143 LDB19Q12502 818 aa9.33□□□□□ -0.92
Q0143Q0143 RIM101P33400 625 aa9.32□□□□□ -0.92
Q0143Q0143 GTT3P39996 337 aa9.24□□□□□ -0.93
Q0143Q0143 ULI1P43604 169 aa9.22□□□□□ -0.93
Q0143Q0143 IOC2Q12072 812 aa9.18□□□□□ -0.94
Q0143Q0143 NCR1Q12200 1170 aa8.99□□□□□ -0.97
Q0143Q0143 RTG1P32607 177 aa8.98□□□□□ -0.97
Q0143Q0143 BBC1P47068 1157 aa8.98□□□□□ -0.97
Q0143Q0143 PTP3P40048 928 aa8.97□□□□□ -0.97
Q0143Q0143 RGA2Q06407 1009 aa8.97□□□□□ -0.97
Q0143Q0143 OXP1P28273 1286 aa8.94□□□□□ -0.98
Q0143Q0143 BCK2P33306 851 aa8.93□□□□□ -0.98
Q0143Q0143 EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Q0143Q0143 YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Q0143Q0143 MSB4Q12317 492 aa8.89□□□□□ -0.99
Q0143Q0143 PIB1Q06651 286 aa8.88□□□□□ -0.99
Q0143Q0143 TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
Q0143Q0143 AI2P03876 854 aa8.82□□□□□ -1
Q0143Q0143 SEC61P32915 480 aa8.82□□□□□ -1
Q0143Q0143 YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
Q0143Q0143 TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
Q0143Q0143 SET4P42948 560 aa8.75□□□□□ -1.01
Q0143Q0143 RSM7P47150 247 aa8.73□□□□□ -1.01
Q0143Q0143 CHL1P22516 861 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
Q0143Q0143 YOL036WQ08206 761 aa8.72□□□□□ -1.01
Q0143Q0143 SAP30P38429 201 aa8.7□□□□□ -1.02
Q0143Q0143 BFR2Q06631 534 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
Q0143Q0143 PRE3P38624 215 aa8.61□□□□□ -1.03
Q0143Q0143 RGA1P39083 1007 aa8.59□□□□□ -1.03
Q0143Q0143 XDJ1P39102 459 aa8.58□□□□□ -1.04
Q0143Q0143 YDL129WQ07555 291 aa8.55□□□□□ -1.04
Q0143Q0143 VRP1P37370 817 aa8.53□□□□□ -1.04
Q0143Q0143 DPS1P04802 557 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
Q0143Q0143 DAN4P47179 1161 aa8.5□□□□□ -1.05
Q0143Q0143 YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Q0143Q0143 JIP4Q03361 876 aa8.46□□□□□ -1.06
Q0143Q0143 MRM1P25270 412 aa8.4□□□□□ -1.06
Q0143Q0143 VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Q0143Q0143 SAM3Q08986 587 aa8.37□□□□□ -1.07
Q0143Q0143 DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Q0143Q0143 YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.34□□□□□ -1.07not detected
Q0143Q0143 YFR006WP43590 535 aa8.32□□□□□ -1.08
Q0143Q0143 PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Q0143Q0143 SRC1Q03707 834 aa8.29□□□□□ -1.08
Q0143Q0143 PTC4P38089 393 aa8.27□□□□□ -1.09
Q0143Q0143 ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
Q0143Q0143 ELP4Q02884 456 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
Q0143Q0143 HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
Q0143Q0143 HTA2P04912 132 aa8.24□□□□□ -1.09
Q0143Q0143 YDR344CQ05510 147 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.6 ms