RNA–Protein interactions for RNA: Q0142

Q0142, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0142, Length 177 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0142Q0142 MTC1P47018 478 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
Q0142Q0142 FAP1P53971 965 aa22.68■■□□□ 1.22
Q0142Q0142 PRY3P47033 881 aa21.4■■□□□ 1.02
Q0142Q0142 AAD16Q02895 342 aa20.47■□□□□ 0.87
Q0142Q0142 PRI1P10363 409 aa20.38■□□□□ 0.85
Q0142Q0142 YCK3P39962 524 aa20.17■□□□□ 0.82
Q0142Q0142 HAA1Q12753 694 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
Q0142Q0142 DRS1P32892 752 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
Q0142Q0142 ISW2Q08773 1120 aa19.45■□□□□ 0.7
Q0142Q0142 RPG1P38249 964 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
Q0142Q0142 TSR3Q12094 313 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
Q0142Q0142 MRPL32P25348 183 aa18.42■□□□□ 0.54
Q0142Q0142 YGL015CP33199 130 aa18.13■□□□□ 0.49
Q0142Q0142 DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
Q0142Q0142 RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
Q0142Q0142 REB1P21538 810 aa17.48■□□□□ 0.39
Q0142Q0142 RPL17AP05740 184 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
Q0142Q0142 RPL17BP46990 184 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
Q0142Q0142 BUD31P25337 157 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
Q0142Q0142 CDC27P38042 758 aa17.22■□□□□ 0.35
Q0142Q0142 UBP10P53874 792 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
Q0142Q0142 MAP2P38174 421 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Q0142Q0142 AVT3P36062 692 aa16.84■□□□□ 0.29
Q0142Q0142 YKR023WP36119 530 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Q0142Q0142 SPT21P35209 758 aa16.53■□□□□ 0.24
Q0142Q0142 HOP09932 586 aa16.43■□□□□ 0.22
Q0142Q0142 DCD1P06773 312 aa16.42■□□□□ 0.22
Q0142Q0142 SIS1P25294 352 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Q0142Q0142 TFC8Q12308 588 aa16.4■□□□□ 0.22
Q0142Q0142 TIF4632P39936 914 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Q0142Q0142 SCY1P53009 804 aa16.23■□□□□ 0.19
Q0142Q0142 UBP9P39967 754 aa16.21■□□□□ 0.19
Q0142Q0142 TGL3P40308 642 aa16.19■□□□□ 0.18
Q0142Q0142 SLX5P32828 619 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Q0142Q0142 BCH2P36122 765 aa15.81■□□□□ 0.12
Q0142Q0142 BFR2Q06631 534 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
Q0142Q0142 RIM101P33400 625 aa15.56■□□□□ 0.08
Q0142Q0142 YBL029C-AQ3E756 94 aa15.38■□□□□ 0.05
Q0142Q0142 MST1P07236 462 aa15.31■□□□□ 0.04
Q0142Q0142 EPS1P40557 701 aa15.28■□□□□ 0.04
Q0142Q0142 BDF1P35817 686 aa15.27■□□□□ 0.04
Q0142Q0142 YOR238WQ08634 303 aa15.18■□□□□ 0.02
Q0142Q0142 VNX1P42839 908 aa15.11■□□□□ 0.01
Q0142Q0142 OXP1P28273 1286 aa15.01□□□□□ -0.01
Q0142Q0142 SPP1Q03012 353 aa14.98□□□□□ -0.01
Q0142Q0142 NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data14.95□□□□□ -0.02not detected
Q0142Q0142 WSC3Q12215 556 aa14.88□□□□□ -0.03
Q0142Q0142 PTP3P40048 928 aa14.85□□□□□ -0.03
Q0142Q0142 YAP5P40574 245 aa14.84□□□□□ -0.03
Q0142Q0142 AIR2Q12476 344 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Q0142Q0142 YJL171CP46992 396 aa14.78□□□□□ -0.04
Q0142Q0142 YIL055CP40523 627 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Q0142Q0142 FKH1P40466 484 aa14.75□□□□□ -0.05
Q0142Q0142 TIF11P38912 153 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Q0142Q0142 BBC1P47068 1157 aa14.69□□□□□ -0.06
Q0142Q0142 AI2P03876 854 aa14.58□□□□□ -0.08
Q0142Q0142 GTT3P39996 337 aa14.57□□□□□ -0.08
Q0142Q0142 RSM7P47150 247 aa14.56□□□□□ -0.08
Q0142Q0142 LDB19Q12502 818 aa14.51□□□□□ -0.09
Q0142Q0142 BMT6Q12291 365 aa14.44□□□□□ -0.1
Q0142Q0142 ULI1P43604 169 aa14.42□□□□□ -0.1
Q0142Q0142 IOC2Q12072 812 aa14.41□□□□□ -0.1
Q0142Q0142 YAH1Q12184 172 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
Q0142Q0142 PIB1Q06651 286 aa14.3□□□□□ -0.12
Q0142Q0142 MSB4Q12317 492 aa14.14□□□□□ -0.15
Q0142Q0142 EAP1P36041 632 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
Q0142Q0142 RTG1P32607 177 aa14.09□□□□□ -0.15
Q0142Q0142 NCR1Q12200 1170 aa14.03□□□□□ -0.16
Q0142Q0142 YLR271WQ06152 274 aa14.02□□□□□ -0.17
Q0142Q0142 TRP5P00931 707 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
Q0142Q0142 SET4P42948 560 aa14□□□□□ -0.17
Q0142Q0142 PSD2P53037 1138 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
Q0142Q0142 YOL036WQ08206 761 aa13.99□□□□□ -0.17
Q0142Q0142 MRM1P25270 412 aa13.97□□□□□ -0.17
Q0142Q0142 YNL035CP53962 389 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
Q0142Q0142 SEC61P32915 480 aa13.88□□□□□ -0.19
Q0142Q0142 DBP1P24784 617 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
Q0142Q0142 YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data13.75□□□□□ -0.21not detected
Q0142Q0142 TFG1P41895 735 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
Q0142Q0142 VMA1P17255 1071 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Q0142Q0142 BCK2P33306 851 aa13.7□□□□□ -0.22
Q0142Q0142 YFR006WP43590 535 aa13.7□□□□□ -0.22
Q0142Q0142 SAP30P38429 201 aa13.68□□□□□ -0.22
Q0142Q0142 VPS29P38759 282 aa13.68□□□□□ -0.22
Q0142Q0142 SAM3Q08986 587 aa13.66□□□□□ -0.22
Q0142Q0142 STS1P38637 319 aa13.61□□□□□ -0.23
Q0142Q0142 DAN4P47179 1161 aa13.61□□□□□ -0.23
Q0142Q0142 CHL1P22516 861 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
Q0142Q0142 YDL129WQ07555 291 aa13.54□□□□□ -0.24
Q0142Q0142 RTG3P38165 486 aa13.53□□□□□ -0.24
Q0142Q0142 JIP4Q03361 876 aa13.53□□□□□ -0.24
Q0142Q0142 PRE3P38624 215 aa13.49□□□□□ -0.25
Q0142Q0142 ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data13.45□□□□□ -0.26not detected
Q0142Q0142 CST9Q06032 482 aa13.44□□□□□ -0.26
Q0142Q0142 GYP5Q12344 894 aa13.41□□□□□ -0.26
Q0142Q0142 ABP1P15891 592 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Q0142Q0142 HTA1P04911 132 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Q0142Q0142 HTA2P04912 132 aa13.36□□□□□ -0.27
Q0142Q0142 SSP1P38871 571 aa13.36□□□□□ -0.27
Q0142Q0142 DCW1P36091 449 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.4 ms