RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622327.4

RAD51C-218, Transcript of RAD51 paralog C, humanhuman

TSL 3

Gene RAD51C, Length 686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51C-218ENST00000622327 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.29■■■□□ 2.12
RAD51C-218ENST00000622327 ABCC9O60706 1549 aa25.84■■□□□ 1.73
RAD51C-218ENST00000622327 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.54■■□□□ 1.68
RAD51C-218ENST00000622327 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.65■■□□□ 1.54
RAD51C-218ENST00000622327 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.46■■□□□ 1.51
RAD51C-218ENST00000622327 NACADO15069 1562 aa24.24■■□□□ 1.47
RAD51C-218ENST00000622327 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
RAD51C-218ENST00000622327 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.9■■□□□ 1.42
RAD51C-218ENST00000622327 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.88■■□□□ 1.41
RAD51C-218ENST00000622327 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.85■■□□□ 1.41
RAD51C-218ENST00000622327 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.8■■□□□ 1.4
RAD51C-218ENST00000622327 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.51■■□□□ 1.35
RAD51C-218ENST00000622327 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.42■■□□□ 1.34
RAD51C-218ENST00000622327 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RAD51C-218ENST00000622327 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.36■■□□□ 1.33
RAD51C-218ENST00000622327 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.35■■□□□ 1.33
RAD51C-218ENST00000622327 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RAD51C-218ENST00000622327 SCRIBQ14160 1630 aa23.18■■□□□ 1.3
RAD51C-218ENST00000622327 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.89■■□□□ 1.25
RAD51C-218ENST00000622327 CUX2O14529 1486 aa22.49■■□□□ 1.19
RAD51C-218ENST00000622327 NCAPD3P42695 1498 aa22.42■■□□□ 1.18
RAD51C-218ENST00000622327 ERCC6Q03468 1493 aa22.29■■□□□ 1.16
RAD51C-218ENST00000622327 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.28■■□□□ 1.16
RAD51C-218ENST00000622327 HMGXB3Q12766 1538 aa22.21■■□□□ 1.15
RAD51C-218ENST00000622327 SMARCA2P51531 1590 aa22.16■■□□□ 1.14
RAD51C-218ENST00000622327 SMARCA4P51532 1647 aa22.13■■□□□ 1.13
RAD51C-218ENST00000622327 NESP48681 1621 aa22.13■■□□□ 1.13
RAD51C-218ENST00000622327 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RAD51C-218ENST00000622327 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.99■■□□□ 1.11
RAD51C-218ENST00000622327 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RAD51C-218ENST00000622327 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RAD51C-218ENST00000622327 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.92■■□□□ 1.1
RAD51C-218ENST00000622327 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.79■■□□□ 1.08
RAD51C-218ENST00000622327 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.79■■□□□ 1.08
RAD51C-218ENST00000622327 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.79■■□□□ 1.08
RAD51C-218ENST00000622327 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.68■■□□□ 1.06
RAD51C-218ENST00000622327 WDR62O43379 1518 aa21.64■■□□□ 1.05
RAD51C-218ENST00000622327 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.64■■□□□ 1.05
RAD51C-218ENST00000622327 TRIM41Q8WV44 630 aa21.57■■□□□ 1.04
RAD51C-218ENST00000622327 WIZO95785 1651 aa21.46■■□□□ 1.03
RAD51C-218ENST00000622327 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.45■■□□□ 1.03
RAD51C-218ENST00000622327 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.41■■□□□ 1.02
RAD51C-218ENST00000622327 CFTRP13569 1480 aa21.39■■□□□ 1.02
RAD51C-218ENST00000622327 OSCARQ8IYS5 282 aa21.32■■□□□ 1
RAD51C-218ENST00000622327 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
RAD51C-218ENST00000622327 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
RAD51C-218ENST00000622327 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
RAD51C-218ENST00000622327 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
RAD51C-218ENST00000622327 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.12■□□□□ 0.97
RAD51C-218ENST00000622327 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.12■□□□□ 0.97
RAD51C-218ENST00000622327 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.12■□□□□ 0.97
RAD51C-218ENST00000622327 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
RAD51C-218ENST00000622327 IFT140Q96RY7 1462 aa21.07■□□□□ 0.96
RAD51C-218ENST00000622327 PRDM2Q13029 1718 aa21.05■□□□□ 0.96
RAD51C-218ENST00000622327 ARHGEF11O15085 1522 aa21.04■□□□□ 0.96
RAD51C-218ENST00000622327 TOPBP1Q92547 1522 aa20.98■□□□□ 0.95
RAD51C-218ENST00000622327 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.96■□□□□ 0.95
RAD51C-218ENST00000622327 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
RAD51C-218ENST00000622327 ABCC8Q09428 1581 aa20.89■□□□□ 0.93
RAD51C-218ENST00000622327 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.86■□□□□ 0.93
RAD51C-218ENST00000622327 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RAD51C-218ENST00000622327 ARAP1Q96P48 1450 aa20.83■□□□□ 0.93
RAD51C-218ENST00000622327 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.81■□□□□ 0.92
RAD51C-218ENST00000622327 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.92
RAD51C-218ENST00000622327 CHD1O14646 1710 aa20.79■□□□□ 0.92
RAD51C-218ENST00000622327 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
RAD51C-218ENST00000622327 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.65■□□□□ 0.9
RAD51C-218ENST00000622327 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.65■□□□□ 0.9
RAD51C-218ENST00000622327 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RAD51C-218ENST00000622327 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RAD51C-218ENST00000622327 WDR97A6NE52 1622 aa20.61■□□□□ 0.89
RAD51C-218ENST00000622327 FBLN2P98095 1184 aa20.61■□□□□ 0.89
RAD51C-218ENST00000622327 SOGA1O94964 1423 aa20.6■□□□□ 0.89
RAD51C-218ENST00000622327 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.59■□□□□ 0.89
RAD51C-218ENST00000622327 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RAD51C-218ENST00000622327 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.54■□□□□ 0.88
RAD51C-218ENST00000622327 SYNJ1O43426 1573 aa20.51■□□□□ 0.87
RAD51C-218ENST00000622327 GRIN2BQ13224 1484 aa20.5■□□□□ 0.87
RAD51C-218ENST00000622327 CUX1P39880 1505 aa20.49■□□□□ 0.87
RAD51C-218ENST00000622327 SYNJ2O15056 1496 aa20.48■□□□□ 0.87
RAD51C-218ENST00000622327 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RAD51C-218ENST00000622327 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.39■□□□□ 0.85
RAD51C-218ENST00000622327 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.34■□□□□ 0.85
RAD51C-218ENST00000622327 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.33■□□□□ 0.85
RAD51C-218ENST00000622327 PBRM1Q86U86 1689 aa20.33■□□□□ 0.85
RAD51C-218ENST00000622327 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.33■□□□□ 0.84
RAD51C-218ENST00000622327 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.26■□□□□ 0.83
RAD51C-218ENST00000622327 NUP160Q12769 1436 aa20.24■□□□□ 0.83
RAD51C-218ENST00000622327 GRIN2AQ12879 1464 aa20.24■□□□□ 0.83
RAD51C-218ENST00000622327 ADAMTS12P58397 1594 aa20.19■□□□□ 0.82
RAD51C-218ENST00000622327 CEP170Q5SW79 1584 aa20.19■□□□□ 0.82
RAD51C-218ENST00000622327 SHROOM2Q13796 1616 aa20.17■□□□□ 0.82
RAD51C-218ENST00000622327 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
RAD51C-218ENST00000622327 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.1■□□□□ 0.81
RAD51C-218ENST00000622327 TOP2BQ02880 1626 aa20.05■□□□□ 0.8
RAD51C-218ENST00000622327 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.05■□□□□ 0.8
RAD51C-218ENST00000622327 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.05■□□□□ 0.8
RAD51C-218ENST00000622327 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.05■□□□□ 0.8
RAD51C-218ENST00000622327 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
RAD51C-218ENST00000622327 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.8 ms